RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 TTC27Q6P3X3 843 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 KLC3Q6P597 504 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZSR9 355 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZT83 130 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 GALNT10Q86SR1 603 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 GGNQ86UU5 652 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 MISPQ8IVT2 679 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA6LQ8N4H0 392 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CEP112Q8N8E3 955 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5M1Q8NGP8 315 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF138Q8WVD3 245 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 OSTF1Q92882 214 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 HPS1Q92902 700 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 MTBPQ96DY7 904 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 FRG2BQ96QU4 278 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 INPP5KQ9BT40 448 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ELOVL6Q9H5J4 265 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ALG9Q9H6U8 611 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 IPPKQ9H8X2 491 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL9Q9P2J3 617 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 UTS2RQ9UKP6 389 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 VDAC3Q9Y277 283 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CIB4A0PJX0 185 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 C7orf72A4D263 438 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC35F4A4IF30 521 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 SERINC4A6NH21 518 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 VSTM5A8MXK1 200 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 SHISA9B4DS77 424 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM157AC9JC47 383 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFSF11O14788 317 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 RAMP1O60894 148 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ANGPTL1O95841 491 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF23P17027 643 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CRABP2P29373 138 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 SPRP35270 261 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF75DP51815 510 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CCNG1P51959 295 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CHN2P52757 468 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CORO7P57737 925 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 GTF2H2Q13888 395 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM83EQ2M2I3 478 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CPTPQ5TA50 214 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 LCE2CQ5TA81 110 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 FCRLAQ7L513 359 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 TRABD2AQ86V40 505 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM9CQ8IZT9 166 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 METTL4Q8N3J2 472 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF175Q8N4F7 328 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 MMGT1Q8N4V1 131 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 L3MBTL4Q8NA19 623 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 RHEBL1Q8TAI7 183 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR20Q8TBZ3 569 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ACTRT2Q8TDY3 377 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF128Q8TEB7 428 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL15Q96M94 604 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 VSTM2LQ96N03 204 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CPNE1Q99829 537 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 LZTFL1Q9NQ48 299 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CES1P1Q9UKY3 287 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 PSAT1Q9Y617 370 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.97□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PS29 197 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLGA8OA6NCC3 632 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5H1A6NKK0 313 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 E7EQL1 145 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLGA8NF8WBI6 632 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLGA8RI6L899 631 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 UBXN8O00124 270 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 FADS1O60427 444 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 PLOD3O60568 738 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 BANF1O75531 89 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 LYZL6O75951 148 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 COL6A2P12110 1019 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ELK4P28324 431 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 GP5P40197 560 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 GSTM5P46439 218 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 RFX3P48380 749 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 PRR5P85299 388 aa6.96□□□□□ -1.3
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