RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 FAAHO00519 579 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 DRD5P21918 477 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 RPP38P78345 283 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 CD47Q08722 323 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 TCF15Q12870 199 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 APOFQ13790 326 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF141Q15928 474 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 PGBD2Q6P3X8 592 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 KLHL17Q6TDP4 642 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 THAP5Q7Z6K1 395 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKRD37Q7Z713 158 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 FBLIM1Q8WUP2 373 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 MCHR1Q99705 422 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 NRSN2Q9GZP1 204 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 FLRT3Q9NZU0 649 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 MYRFQ9Y2G1 1151 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 OR10H1Q9Y4A9 318 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 DYRK3O43781 588 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 UGT2B11O75310 529 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 CYP7B1O75881 506 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 TAS2R41P59536 307 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 KEAP1Q14145 624 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 MEP1AQ16819 746 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 EIPR1Q53HC9 387 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC157Q569K6 752 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 NLGN4XQ8N0W4 816 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 C7orf57Q8NEG2 295 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 UBE2FQ969M7 185 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 PITX2Q99697 317 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 GPA33Q99795 319 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 G6PC3Q9BUM1 346 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 PARD6AQ9NPB6 346 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM9BQ9NQ34 198 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 TOR4AQ9NXH8 423 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 AASSQ9UDR5 926 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 TMCC3Q9ULS5 477 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 POFUT2Q9Y2G5 429 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A087WUU8 490 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 TNFRSF10AO00220 468 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 MAGEB3O15480 346 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 ALOX12BO75342 701 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 HEXBP07686 556 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 RYKP34925 604 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 ETV5P41161 510 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 CDH15P55291 814 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 SMIM11AP58511 58 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 ZER1Q7Z7L7 766 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 NKAIN4Q8IVV8 208 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 PARP8Q8N3A8 854 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 APCDD1LQ8NCL9 501 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 HRASLS5Q96KN8 279 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 CDC14CA4D256 554 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 FRG2CA6NGY1 282 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 C4orf47A7E2U8 309 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 OR10H3O60404 316 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 TFAP2AP05549 437 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP12AP54707 1039 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 IL18R1Q13478 541 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 DESI1Q6ICB0 168 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 GDF7Q7Z4P5 450 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 SLCO6A1Q86UG4 719 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 OR4K5Q8NGD3 323 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 FKBP10Q96AY3 582 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 GAL3ST4Q96RP7 486 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC39A1Q9NY26 324 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 KNTC1P50748 2209 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 B4E171 279 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 AP3D1O14617 1153 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 ADAP00813 363 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 TP53P04637 393 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 AGXTP21549 392 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 TGM1P22735 817 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 MMP11P24347 488 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 TSPAN7P41732 249 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 FGFBP1Q14512 234 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 CNPY1Q3B7I2 92 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 KCTD21Q4G0X4 260 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms