RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 TCTN2Q96GX1 697 aa6.81□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 APIPQ96GX9 242 aa6.81□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.81□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 FBXL3Q9UKT7 428 aa6.81□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa6.81□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 AMY2AP04746 511 aa6.81□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 NUDT7P0C024 238 aa6.81□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 ICAM2P13598 275 aa6.81□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 CPT2P23786 658 aa6.81□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 PRSS3P35030 304 aa6.81□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 P2RY2P41231 377 aa6.81□□□□□ -1.32
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CPS1-201ENST00000233072 RAB38P57729 211 aa6.81□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 DUSP7Q16829 419 aa6.81□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.81□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa6.81□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 ARL11Q969Q4 196 aa6.81□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
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CPS1-201ENST00000233072 INTS14Q96SY0 518 aa6.81□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 FUNDC2Q9BWH2 189 aa6.81□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 BCAS3Q9H6U6 928 aa6.81□□□□□ -1.32
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CPS1-201ENST00000233072 PTGESO14684 152 aa6.8□□□□□ -1.32
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CPS1-201ENST00000233072 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 CSNK1A1P48729 337 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 EPHA4P54764 986 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 BLOC1S1P78537 153 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 NFATC4Q14934 902 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 LAPTM4AQ15012 233 aa6.8□□□□□ -1.32
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CPS1-201ENST00000233072 ZNF595Q8IYB9 648 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 NPWQ8N729 165 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 OR1J2Q8NGS2 313 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 OR9A2Q8NGT5 310 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 NETO1Q8TDF5 533 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 MALSU1Q96EH3 234 aa6.8□□□□□ -1.32
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CPS1-201ENST00000233072 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 CLMPQ9H6B4 373 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 C19orf12Q9NSK7 152 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 GPR83Q9NYM4 423 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 GLTPQ9NZD2 209 aa6.8□□□□□ -1.32
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CPS1-201ENST00000233072 CBLCQ9ULV8 474 aa6.8□□□□□ -1.32
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CPS1-201ENST00000233072 SLC35F4A4IF30 521 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 RFPL2O75678 378 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 UPK1BO75841 260 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 HTR3BO95264 441 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 TUBG1P23258 451 aa6.8□□□□□ -1.32
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CPS1-201ENST00000233072 NAXEQ8NCW5 288 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 OR5D14Q8NGL3 314 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 OR4K13Q8NH42 304 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 OR14A2Q96R54 314 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 MOKQ9UQ07 419 aa6.8□□□□□ -1.32
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CPS1-201ENST00000233072 SLC2A5P22732 501 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 CD6P30203 668 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 CPOXP36551 454 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 THBS3P49746 956 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 AKR1C2P52895 323 aa6.8□□□□□ -1.32
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CPS1-201ENST00000233072 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 CLECL1Q8IZS7 167 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 SAMD8Q96LT4 415 aa6.8□□□□□ -1.32
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CPS1-201ENST00000233072 TTTY10Q9BZA0 68 aa6.8□□□□□ -1.32
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CPS1-201ENST00000233072 CHRDQ9H2X0 955 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 OBP2AQ9NY56 170 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 IL17CQ9P0M4 197 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 RIMS3Q9UJD0 308 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 POLHQ9Y253 713 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 ANKRD33BA6NCL7 494 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 GPR137BO60478 399 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 PAHP00439 452 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 TMEM225BP0DP42 221 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 AKR1C4P17516 323 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 CNR2P34972 360 aa6.8□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 ATP1B3P54709 279 aa6.8□□□□□ -1.32
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