RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Alyref2Q9JJW6 218 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv15-103A0A140T8P3 115 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm17067E9Q6S4 354 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mapk12O08911 367 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atxn2O70305 1285 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 H2-K1P01901 369 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wnt1P04426 370 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PlauP06869 433 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zp2P20239 713 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl6P47911 296 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smad4P97471 551 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cds1P98191 461 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tfb2mQ3TL26 396 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdk10Q3UMM4 360 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tlx2Q61663 284 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tvp23aQ6NVH0 222 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dpp10Q6NXK7 797 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 D11Wsu47eQ6PIX9 558 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CebpeQ6PZD9 281 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd276Q8VE98 316 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prb1Q91X93 504 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lims1Q99JW4 325 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pfdn1Q9CWM4 122 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hspb11Q9D6H2 143 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btnl10Q9JK39 275 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lpar2Q9JL06 348 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnfsf14Q9QYH9 239 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bloc1s6Q9R0C0 172 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnk7Q9Z2T1 307 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A0A1W2P799 418 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mtnd3P03899 115 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gabra3P26049 492 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cers1P27545 350 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pou3f2P31360 445 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AcadlP51174 430 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GlaP51569 419 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gdf9Q07105 441 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Defb43Q30KM9 69 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr681Q3SXH8 315 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 E330014E10RikQ3UL33 481 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 D5Ertd577eQ499F0 481 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MuskQ61006 868 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc29a2Q61672 456 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fgl1Q71KU9 314 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr744Q7TRM0 323 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smyd4Q8BTK5 799 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cmtr2Q8BWQ4 767 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr952Q8VFD7 314 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1346Q8VGH6 313 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr679Q8VGV0 315 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr586Q8VH13 317 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dusp7Q91Z46 422 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 C1qtnf2Q9D8U4 294 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr955Q9EQ97 314 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tsga8Q9JJL0 238 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gdf2Q9WV56 428 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lsm2O35900 95 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stmn3O70166 180 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tspan6O70401 245 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ntrk2P15209 821 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp60P16374 707 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klrb1aP27811 227 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpina3mQ03734 418 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Foxred1Q3TQB2 487 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mylk4Q5SUV5 386 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prkg2Q61410 762 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf728Q6P5C7 752 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr75Q6X632 540 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eml2Q7TNG5 649 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cadm2Q8BLQ9 435 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmsb15lQ8C0W0 80 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ikzf4Q8C208 586 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Yod1Q8CB27 343 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nudt6Q8CH40 313 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Agpat4Q8K4X7 378 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr347Q8VGK2 312 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr394Q8VGR5 310 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrm1Q99J25 320 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4930553M12RikQ9CUH1 165 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Capns2Q9D7J7 247 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tvp23bQ9D8T4 205 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r52Q9EP79 309 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pard6gQ9JK84 382 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tcea2Q9QVN7 299 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DptQ9QZZ6 201 aa11.85□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gtf3c1Q8K284 2101 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mfsd13bA0A1L1SUA2 455 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1095A3KPP7 308 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr619E9PV95 320 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r58G3X9U3 310 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GypaP14220 168 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klk1P15947 261 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DctP29812 517 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igfbp3P47878 292 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ripk1Q60855 656 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nsg1Q62092 185 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pced1aQ6P1Z5 449 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfand1Q8BFR6 268 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mospd3Q8BGG6 235 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Derl2Q8BNI4 239 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.9 ms