RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639850.1

ME2-216, Transcript of malic enzyme 2, human

TSL 5 BASIC

Gene ME2, Length 2,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ME2-216	ENST00000639850	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	24.94	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	24.94	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		24.94	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		24.94	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	24.93	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	PALD1	Q9ULE6	856 aa		24.93	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	NRAP	Q86VF7	1730 aa		24.93	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		24.92	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		24.92	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	NEK4	P51957	841 aa		24.91	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	TCIRG1	Q13488	830 aa		24.91	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		24.91	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	24.91	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	24.91	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	TFCP2	Q12800	502 aa		24.91	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	24.91	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	24.91	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	PIP4K2B	P78356	416 aa		24.9	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	GSE1	Q14687	1217 aa		24.9	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		24.9	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		24.9	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	MCM4	P33991	863 aa		24.9	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	TOM1	O60784	492 aa		24.89	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	HSPA4	P34932	840 aa		24.89	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	TNNI3K	Q59H18	835 aa		24.89	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		24.89	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	RAD50	Q92878	1312 aa		24.89	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	ARX	Q96QS3	562 aa		24.89	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		24.89	■■□□□ 1.58
ME2-216	ENST00000639850	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	24.89	■■□□□ 1.57
ME2-216	ENST00000639850	DDB1	Q16531	1140 aa		24.89	■■□□□ 1.57
ME2-216	ENST00000639850	IL17RA	Q96F46	866 aa		24.89	■■□□□ 1.57
ME2-216	ENST00000639850	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		24.89	■■□□□ 1.57
ME2-216	ENST00000639850	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		24.88	■■□□□ 1.57
ME2-216	ENST00000639850	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	24.88	■■□□□ 1.57
ME2-216	ENST00000639850	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	24.88	■■□□□ 1.57
ME2-216	ENST00000639850	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		24.87	■■□□□ 1.57
ME2-216	ENST00000639850	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	24.87	■■□□□ 1.57
ME2-216	ENST00000639850	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	24.86	■■□□□ 1.57
ME2-216	ENST00000639850	HIP1	O00291	1037 aa		24.86	■■□□□ 1.57
ME2-216	ENST00000639850	MCM2	P49736	904 aa		24.86	■■□□□ 1.57
ME2-216	ENST00000639850	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	24.86	■■□□□ 1.57
ME2-216	ENST00000639850	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	24.86	■■□□□ 1.57
ME2-216	ENST00000639850	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		24.85	■■□□□ 1.57
ME2-216	ENST00000639850	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		24.84	■■□□□ 1.57
ME2-216	ENST00000639850	ATP5J	P18859	108 aa		24.83	■■□□□ 1.57
ME2-216	ENST00000639850	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	24.83	■■□□□ 1.57
ME2-216	ENST00000639850	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	24.83	■■□□□ 1.57
ME2-216	ENST00000639850	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		24.83	■■□□□ 1.57
ME2-216	ENST00000639850	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		24.83	■■□□□ 1.57
ME2-216	ENST00000639850	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		24.83	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	FSD1	Q9BTV5	496 aa		24.83	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	24.82	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850		A0A0G2JS52	829 aa		24.81	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	24.81	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		24.81	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	24.81	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		24.81	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	24.81	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	HLF	Q16534	295 aa		24.8	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	IL27	Q8NEV9	243 aa		24.8	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	FAM89A	Q96GI7	184 aa		24.8	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	GBP4	Q96PP9	640 aa		24.8	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		24.8	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	24.8	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		24.8	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	24.8	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	24.8	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	TMX3	Q96JJ7	454 aa		24.8	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	FAM227B	Q96M60	508 aa		24.8	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		24.79	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	EYA2	O00167	538 aa		24.79	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	24.79	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	SLIT2	O94813	1529 aa		24.79	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		24.79	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	PTH1R	Q03431	593 aa		24.79	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		24.79	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	NUP98	P52948	1817 aa		24.78	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		24.78	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	GPR108	Q9NPR9	543 aa		24.78	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	LRRC24	Q50LG9	513 aa		24.78	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		24.78	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	24.78	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		24.78	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	CIAO1	O76071	339 aa		24.77	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	GPT	P24298	496 aa		24.77	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	SSFA2	P28290	1259 aa		24.77	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	24.77	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	NUCB2	P80303	420 aa		24.77	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	RASEF	Q8IZ41	740 aa		24.77	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		24.77	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	24.77	■■□□□ 1.56
ME2-216	ENST00000639850	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		24.76	■■□□□ 1.55
ME2-216	ENST00000639850	NLRP10	Q86W26	655 aa		24.76	■■□□□ 1.55
ME2-216	ENST00000639850	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	24.75	■■□□□ 1.55
ME2-216	ENST00000639850		A0A0D9SFI3	127 aa		24.75	■■□□□ 1.55
ME2-216	ENST00000639850	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	24.75	■■□□□ 1.55
ME2-216	ENST00000639850	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	24.75	■■□□□ 1.55
ME2-216	ENST00000639850	HAUS7	Q99871	368 aa		24.75	■■□□□ 1.55
ME2-216	ENST00000639850	SNRK	Q9NRH2	765 aa		24.75	■■□□□ 1.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms