RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639482.1

SPIN3-222, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 3

Gene SPIN3, Length 3,719 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-222	ENST00000639482	UBE2H	P62256	183 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	LRMP	Q12912	555 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	ATP2B3	Q16720	1220 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	NPHP1	O15259	732 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	HSPA4	P34932	840 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	CYP27B1	O15528	508 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	ANAPC15	P60006	121 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	PTH1R	Q03431	593 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	CNTROB	Q8N137	903 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	TRIM5	Q9C035	493 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	SLAIN2	Q9P270	581 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	SIL1	Q9H173	461 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482		A0A087WWV3	80 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	11.96	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	SGSM2	O43147	1006 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	BICD2	Q8TD16	824 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	USP16	Q9Y5T5	823 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SPIN3-222	ENST00000639482	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	MEGF6	O75095	1541 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	LIG1	P18858	919 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	DDX11	Q96FC9	970 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC192	P0DO97	292 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	RAD50	Q92878	1312 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	RAB11FIP3	O75154	756 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	DACT1	Q9NYF0	836 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	PHKG2	P15735	406 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482		A0A0G2JS52	829 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	ME3	Q16798	604 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF790	Q6PG37	636 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM227B	Q96M60	508 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	TNMD	Q9H2S6	317 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	MTMR6	Q9Y217	621 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	FGD1	P98174	961 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	UVSSA	Q2YD98	709 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	TTC6	Q86TZ1	520 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	BEND3	Q5T5X7	828 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	AACS	Q86V21	672 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	ADCY9	O60503	1353 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	MAP3K11	Q16584	847 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5

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