RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637140.1

ATP6AP2-222, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 2, human

TSL 2

Gene ATP6AP2, Length 587 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CD33	P20138	364 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	EFS	O43281	561 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ARAF	P10398	606 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	LAMC2	Q13753	1193 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	HINFP	Q9BQA5	517 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ZMYND15	Q9H091	742 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	EPX	P11678	715 aa		7	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ARX	Q96QS3	562 aa		7	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	STRN4	Q9NRL3	753 aa		7	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	MARK1	Q9P0L2	795 aa		7	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	GATA4	P43694	442 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	DGKG	P49619	791 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	LGR5	O75473	907 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	RFX1	P22670	979 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	IGFBP4	P22692	258 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CDCA8	Q53HL2	280 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	KLF15	Q9UIH9	416 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ADH6	P28332	368 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SUSD3	Q96L08	255 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		6.96	□□□□□ -1.29
ATP6AP2-222	ENST00000637140	LCE3B	Q5TA77	95 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CHSY3	Q70JA7	882 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	WEE1	P30291	646 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	HIF1A	Q16665	826 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	NGLY1	Q96IV0	654 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CEP63	Q96MT8	703 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	TYRO3	Q06418	890 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	RTN1	Q16799	776 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	BRD7	Q9NPI1	651 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	KCNQ4	P56696	695 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SYT9	Q86SS6	491 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PLVAP	Q9BX97	442 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	FOXO3	O43524	673 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SPEM2	Q0P670	501 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	TRIM11	Q96F44	468 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SLC30A3	Q99726	388 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SIN3B	O75182	1162 aa		6.91	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		6.91	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		6.91	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		6.91	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	IER5	Q5VY09	327 aa		6.91	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		6.91	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		6.91	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CFTR	P13569	1480 aa		6.91	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		6.9	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ATG7	O95352	703 aa		6.9	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		6.9	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ARTN	Q5T4W7	220 aa		6.9	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ELOA3	Q8NG57	546 aa		6.9	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	MDFI	Q99750	246 aa		6.9	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		6.9	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	BCS1L	Q9Y276	419 aa		6.9	□□□□□ -1.3
ATP6AP2-222	ENST00000637140	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.31
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		6.89	□□□□□ -1.31

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