RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.41■■□□□ 1.82
CSAG3-202ENST00000617158 CASZ1Q86V15 1759 aa26.41■■□□□ 1.82
CSAG3-202ENST00000617158 H7C1W4 665 aa26.4■■□□□ 1.82
CSAG3-202ENST00000617158 SUSD4Q5VX71 490 aa26.4■■□□□ 1.82
CSAG3-202ENST00000617158 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CSAG3-202ENST00000617158 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP26.4■■□□□ 1.82
CSAG3-202ENST00000617158 TM4SF1P30408 202 aa26.39■■□□□ 1.82
CSAG3-202ENST00000617158 NFIXQ14938 502 aa26.39■■□□□ 1.82
CSAG3-202ENST00000617158 GRM8O00222 908 aa26.38■■□□□ 1.81
CSAG3-202ENST00000617158 SYNE4Q8N205 404 aa26.38■■□□□ 1.81
CSAG3-202ENST00000617158 KAZALD1Q96I82 304 aa26.38■■□□□ 1.81
CSAG3-202ENST00000617158 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.37■■□□□ 1.81
CSAG3-202ENST00000617158 MSH5O43196 834 aa26.36■■□□□ 1.81
CSAG3-202ENST00000617158 NTSR2O95665 410 aa26.36■■□□□ 1.81
CSAG3-202ENST00000617158 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.36■■□□□ 1.81
CSAG3-202ENST00000617158 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
CSAG3-202ENST00000617158 DDR1Q08345 913 aa26.35■■□□□ 1.81
CSAG3-202ENST00000617158 PARP10Q53GL7 1025 aa26.35■■□□□ 1.81
CSAG3-202ENST00000617158 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa26.35■■□□□ 1.81
CSAG3-202ENST00000617158 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa26.34■■□□□ 1.81
CSAG3-202ENST00000617158 SUCLG2Q96I99 432 aa26.34■■□□□ 1.81
CSAG3-202ENST00000617158 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CSAG3-202ENST00000617158 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
CSAG3-202ENST00000617158 GNAI3P08754 354 aa26.33■■□□□ 1.81
CSAG3-202ENST00000617158 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
CSAG3-202ENST00000617158 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
CSAG3-202ENST00000617158 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.33■■□□□ 1.81
CSAG3-202ENST00000617158 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
CSAG3-202ENST00000617158 FAM89AQ96GI7 184 aa26.33■■□□□ 1.81
CSAG3-202ENST00000617158 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.33■■□□□ 1.81
CSAG3-202ENST00000617158 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.32■■□□□ 1.8
CSAG3-202ENST00000617158 FAM177BA6PVY3 158 aa26.32■■□□□ 1.8
CSAG3-202ENST00000617158 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
CSAG3-202ENST00000617158 MSL1Q68DK7 614 aa26.32■■□□□ 1.8
CSAG3-202ENST00000617158 SETDB2Q96T68 719 aa26.32■■□□□ 1.8
CSAG3-202ENST00000617158 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
CSAG3-202ENST00000617158 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.31■■□□□ 1.8
CSAG3-202ENST00000617158 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.31■■□□□ 1.8
CSAG3-202ENST00000617158 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CSAG3-202ENST00000617158 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CSAG3-202ENST00000617158 LAMB2P55268 1798 aa26.3■■□□□ 1.8
CSAG3-202ENST00000617158 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
CSAG3-202ENST00000617158 SIRT2Q8IXJ6 389 aa26.3■■□□□ 1.8
CSAG3-202ENST00000617158 CDHR2Q9BYE9 1310 aa26.3■■□□□ 1.8
CSAG3-202ENST00000617158 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.3■■□□□ 1.8
CSAG3-202ENST00000617158 GNAI2P04899 355 aa26.29■■□□□ 1.8
CSAG3-202ENST00000617158 FOXO4P98177 505 aa26.29■■□□□ 1.8
CSAG3-202ENST00000617158 AAMPQ13685 434 aa26.29■■□□□ 1.8
CSAG3-202ENST00000617158 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.29■■□□□ 1.8
CSAG3-202ENST00000617158 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.29■■□□□ 1.8
CSAG3-202ENST00000617158 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.28■■□□□ 1.8
CSAG3-202ENST00000617158 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
CSAG3-202ENST00000617158 ABCC12Q96J65 1359 aa26.28■■□□□ 1.8
CSAG3-202ENST00000617158 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
CSAG3-202ENST00000617158 ERFEQ4G0M1 354 aa26.27■■□□□ 1.8
CSAG3-202ENST00000617158 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26.27■■□□□ 1.8
CSAG3-202ENST00000617158 CEP85Q6P2H3 762 aa26.26■■□□□ 1.79
CSAG3-202ENST00000617158 SLC16A10Q8TF71 515 aa26.26■■□□□ 1.79
CSAG3-202ENST00000617158 PLA2G12BQ9BX93 195 aa26.26■■□□□ 1.79
CSAG3-202ENST00000617158 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CSAG3-202ENST00000617158 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CSAG3-202ENST00000617158 SERPINB2P05120 415 aa26.25■■□□□ 1.79
CSAG3-202ENST00000617158 MMP10P09238 476 aa26.25■■□□□ 1.79
CSAG3-202ENST00000617158 SLC10A5Q5PT55 438 aa26.25■■□□□ 1.79
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.25■■□□□ 1.79
CSAG3-202ENST00000617158 MYH3P11055 1940 aa26.24■■□□□ 1.79
CSAG3-202ENST00000617158 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CSAG3-202ENST00000617158 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CSAG3-202ENST00000617158 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CSAG3-202ENST00000617158 PRR5LQ6MZQ0 368 aa26.24■■□□□ 1.79
CSAG3-202ENST00000617158 C3orf67Q6ZVT6 689 aa26.24■■□□□ 1.79
CSAG3-202ENST00000617158 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CSAG3-202ENST00000617158 NYXQ9GZU5 481 aa26.23■■□□□ 1.79
CSAG3-202ENST00000617158 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.23■■□□□ 1.79
CSAG3-202ENST00000617158 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.22■■□□□ 1.79
CSAG3-202ENST00000617158 ATP8B2P98198 1209 aa26.22■■□□□ 1.79
CSAG3-202ENST00000617158 MTX1Q13505 466 aa26.22■■□□□ 1.79
CSAG3-202ENST00000617158 ZBTB7AO95365 584 aa26.21■■□□□ 1.79
CSAG3-202ENST00000617158 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.21■■□□□ 1.79
CSAG3-202ENST00000617158 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.21■■□□□ 1.79
CSAG3-202ENST00000617158 IGHDP01880 384 aa26.2■■□□□ 1.78
CSAG3-202ENST00000617158 CSF1RP07333 972 aa26.2■■□□□ 1.78
CSAG3-202ENST00000617158 PDE8AO60658 829 aa26.19■■□□□ 1.78
CSAG3-202ENST00000617158 LMBR1LQ6UX01 489 aa26.19■■□□□ 1.78
CSAG3-202ENST00000617158 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
CSAG3-202ENST00000617158 CNBD1Q8NA66 436 aa26.19■■□□□ 1.78
CSAG3-202ENST00000617158 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.19■■□□□ 1.78
CSAG3-202ENST00000617158 COL4A1P02462 1669 aa26.19■■□□□ 1.78
CSAG3-202ENST00000617158 SOCS7O14512 581 aa26.18■■□□□ 1.78
CSAG3-202ENST00000617158 POLA2Q14181 598 aa26.18■■□□□ 1.78
CSAG3-202ENST00000617158 TTLL11Q8NHH1 800 aa26.18■■□□□ 1.78
CSAG3-202ENST00000617158 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CSAG3-202ENST00000617158 CTSWP56202 376 aa26.17■■□□□ 1.78
CSAG3-202ENST00000617158 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.17■■□□□ 1.78
CSAG3-202ENST00000617158 SSH3Q8TE77 659 aa26.17■■□□□ 1.78
CSAG3-202ENST00000617158 SGIP1Q9BQI5 828 aa26.17■■□□□ 1.78
CSAG3-202ENST00000617158 MTFR1LQ9H019 292 aa26.17■■□□□ 1.78
CSAG3-202ENST00000617158 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.17■■□□□ 1.78
CSAG3-202ENST00000617158 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CSAG3-202ENST00000617158 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms