RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.34■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC148Q8NFR7 591 aa23.34■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 NEK1Q96PY6 1258 aa23.34■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 F8W031 263 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 TSPY3P0CV98 308 aa23.34■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 TSPY8P0CW00 308 aa23.34■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.34■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.34■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.34■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC178Q5BJE1 867 aa23.34■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 SYCE3A1L190 88 aa23.33■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 SIRT1Q96EB6 747 aa23.33■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa23.33■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 STX8Q9UNK0 236 aa23.33■■□□□ 1.33
CTDP1-208ENST00000613122 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.33■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.33■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 CETN1Q12798 172 aa23.33■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 LEKR1Q6ZMV7 388 aa23.32■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 RHPN1Q8TCX5 695 aa23.32■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.32■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC183Q5T5S1 534 aa23.31■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 SLC26A6Q9BXS9 759 aa23.31■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 KRT23Q9C075 422 aa23.31■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 CTAGE5O15320 804 aa23.31■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 ALDH1L1O75891 902 aa23.31■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.31■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 EZRP15311 586 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 TRAF1Q13077 416 aa23.31■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 ATP10BO94823 1461 aa23.31■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 HSPA2P54652 639 aa23.3■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.3■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 WTAPQ15007 396 aa23.3■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 KSR2Q6VAB6 950 aa23.3■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 IDEP14735 1019 aa23.3■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 MCM5P33992 734 aa23.3■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 ANAPC15P60006 121 aa23.3■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.29■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 GRM8O00222 908 aa23.29■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.29■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.29■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 GJB2P29033 226 aa23.29■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 FSIP1Q8NA03 581 aa23.29■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 PICALMQ13492 652 aa23.29■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 UBA7P41226 1012 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 FAM193AP78312 1265 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 NF2P35240 595 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 SYCP3Q8IZU3 236 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 DRC1Q96MC2 740 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 TOP1P11387 765 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 TTC22Q5TAA0 569 aa23.27■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 ESR2Q92731 530 aa23.27■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 LRRC27Q9C0I9 530 aa23.27■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 FLT4P35916 1363 aa23.27■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 GRM1Q13255 1194 aa23.27■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC40Q4G0X9 1142 aa23.27■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 CNNM2Q9H8M5 875 aa23.27■■□□□ 1.32
CTDP1-208ENST00000613122 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 FERMT2Q96AC1 680 aa23.26■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 ZSCAN12O43309 604 aa23.26■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 TCERG1LQ5VWI1 586 aa23.26■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.26■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.26■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.26■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 JDP2Q8WYK2 163 aa23.26■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.25■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 TMTC2Q8N394 836 aa23.25■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 ERMNQ8TAM6 284 aa23.25■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 VEZTQ9HBM0 779 aa23.24■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 MEIS3Q99687 375 aa23.24■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 TBCAO75347 108 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 YEATS4O95619 227 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
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