RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 SOGA3Q5TF21 947 aa22.2■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.2■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.2■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.2■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 NLRP10Q86W26 655 aa22.2■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.2■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 NFKBIEO00221 500 aa22.19■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 TSPYL6Q8N831 410 aa22.19■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 C21orf2O43822 256 aa22.18■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 RASSF7Q02833 373 aa22.18■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 LMNB1P20700 586 aa22.17■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 GOLGA2Q08379 1002 aa22.17■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.17■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.17■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 RNF181Q9P0P0 153 aa22.17■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 ZNF521Q96K83 1311 aa22.16■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 CCER2I3L3R5 266 aa22.16■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 ALDH1B1P30837 517 aa22.16■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.16■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 SNED1Q8TER0 1413 aa22.15■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.14■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.14■■□□□ 1.14
HERC3-214ENST00000601319 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HERC3-214ENST00000601319 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HERC3-214ENST00000601319 MYH3P11055 1940 aa22.14■■□□□ 1.13
HERC3-214ENST00000601319 PRELPP51888 382 aa22.13■■□□□ 1.13
HERC3-214ENST00000601319 CCDC93Q567U6 631 aa22.13■■□□□ 1.13
HERC3-214ENST00000601319 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.13■■□□□ 1.13
HERC3-214ENST00000601319 STK31Q9BXU1 1019 aa22.13■■□□□ 1.13
HERC3-214ENST00000601319 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.13■■□□□ 1.13
HERC3-214ENST00000601319 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.13■■□□□ 1.13
HERC3-214ENST00000601319 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HERC3-214ENST00000601319 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.12■■□□□ 1.13
HERC3-214ENST00000601319 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HERC3-214ENST00000601319 NLRP3Q96P20 1036 aa22.12■■□□□ 1.13
HERC3-214ENST00000601319 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HERC3-214ENST00000601319 TAF1P21675 1872 aa22.11■■□□□ 1.13
HERC3-214ENST00000601319 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.11■■□□□ 1.13
HERC3-214ENST00000601319 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HERC3-214ENST00000601319 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
HERC3-214ENST00000601319 WDR90Q96KV7 1748 aa22.09■■□□□ 1.13
HERC3-214ENST00000601319 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.09■■□□□ 1.13
HERC3-214ENST00000601319 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.09■■□□□ 1.13
HERC3-214ENST00000601319 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HERC3-214ENST00000601319 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.08■■□□□ 1.13
HERC3-214ENST00000601319 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.08■■□□□ 1.13
HERC3-214ENST00000601319 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
HERC3-214ENST00000601319 VAMP4O75379 141 aa22.07■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 C1QTNF8P60827 252 aa22.07■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.07■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 KSR2Q6VAB6 950 aa22.07■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 SYNE4Q8N205 404 aa22.07■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 KIF3CO14782 793 aa22.06■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.06■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 ABCC4O15439 1325 aa22.06■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 SLC4A2P04920 1241 aa22.05■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 FAM89AQ96GI7 184 aa22.05■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 PSMD1Q99460 953 aa22.05■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 MYD88Q99836 296 aa22.05■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.05■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 LTBP1Q14766 1721 aa22.04■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 OLFM4Q6UX06 510 aa22.04■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.03■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 FLIIQ13045 1269 aa22.03■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 G2E3Q7L622 706 aa22.03■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.03■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.03■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 SCN4AP35499 1836 aa22.03■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 COL4A1P02462 1669 aa22.02■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 GLTPD2A6NH11 291 aa22.02■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.02■■□□□ 1.12
HERC3-214ENST00000601319 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
HERC3-214ENST00000601319 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.01■■□□□ 1.11
HERC3-214ENST00000601319 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
HERC3-214ENST00000601319 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22■■□□□ 1.11
HERC3-214ENST00000601319 E9PSI1 815 aa22■■□□□ 1.11
HERC3-214ENST00000601319 BBOX1O75936 387 aa22■■□□□ 1.11
HERC3-214ENST00000601319 IGKV5-2P06315 115 aa22■■□□□ 1.11
HERC3-214ENST00000601319 GRAPQ13588 217 aa22■■□□□ 1.11
HERC3-214ENST00000601319 TMC4Q7Z404 712 aa22■■□□□ 1.11
HERC3-214ENST00000601319 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
HERC3-214ENST00000601319 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
HERC3-214ENST00000601319 SPEF2Q9C093 1822 aa22■■□□□ 1.11
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