RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599766.5

FCHO1-229, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 3

Gene FCHO1, Length 747 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-229ENST00000599766 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.53■■□□□ 1.2
FCHO1-229ENST00000599766 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
FCHO1-229ENST00000599766 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
FCHO1-229ENST00000599766 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.51■■□□□ 1.19
FCHO1-229ENST00000599766 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
FCHO1-229ENST00000599766 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.51■■□□□ 1.19
FCHO1-229ENST00000599766 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.51■■□□□ 1.19
FCHO1-229ENST00000599766 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.51■■□□□ 1.19
FCHO1-229ENST00000599766 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.5■■□□□ 1.19
FCHO1-229ENST00000599766 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
FCHO1-229ENST00000599766 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.5■■□□□ 1.19
FCHO1-229ENST00000599766 ABHD8Q96I13 439 aa22.5■■□□□ 1.19
FCHO1-229ENST00000599766 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.49■■□□□ 1.19
FCHO1-229ENST00000599766 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
FCHO1-229ENST00000599766 SCNN1DP51172 638 aa22.48■■□□□ 1.19
FCHO1-229ENST00000599766 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
FCHO1-229ENST00000599766 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.48■■□□□ 1.19
FCHO1-229ENST00000599766 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.47■■□□□ 1.19
FCHO1-229ENST00000599766 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.47■■□□□ 1.19
FCHO1-229ENST00000599766 NGEFQ8N5V2 710 aa22.47■■□□□ 1.19
FCHO1-229ENST00000599766 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.47■■□□□ 1.19
FCHO1-229ENST00000599766 PPP2R1AP30153 589 aa22.46■■□□□ 1.19
FCHO1-229ENST00000599766 EPS15P42566 896 aa22.46■■□□□ 1.19
FCHO1-229ENST00000599766 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
FCHO1-229ENST00000599766 CAPNS2Q96L46 248 aa22.46■■□□□ 1.19
FCHO1-229ENST00000599766 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.46■■□□□ 1.19
FCHO1-229ENST00000599766 ECE1P42892 770 aa22.45■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.45■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.45■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.44■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 GPTP24298 496 aa22.43■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.43■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 SUSD4Q5VX71 490 aa22.42■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 CST9Q5W186 159 aa22.42■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.42■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 NIM1KQ8IY84 436 aa22.42■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 TRAF5O00463 557 aa22.41■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 SLC51AQ86UW1 340 aa22.41■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.41■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.41■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.41■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 NTSR2O95665 410 aa22.4■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 MYL6BP14649 208 aa22.4■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 GRM1Q13255 1194 aa22.4■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 FAM161AQ3B820 660 aa22.4■■□□□ 1.18
FCHO1-229ENST00000599766 PPIP5K2O43314 1243 aa22.39■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.39■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 VPS33BQ9H267 617 aa22.39■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.39■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 SLC34A2O95436 690 aa22.38■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 MAP2K2P36507 400 aa22.38■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 ERBB4Q15303 1308 aa22.37■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 NEFMP07197 916 aa22.37■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 AOC3Q16853 763 aa22.37■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 PARP10Q53GL7 1025 aa22.37■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.37■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 NLRP3Q96P20 1036 aa22.37■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.37■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.36■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 AOC2O75106 756 aa22.35■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 CXCL9Q07325 125 aa22.35■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.35■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.34■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.34■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.34■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 ABCC4O15439 1325 aa22.33■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.33■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 LAMB2P55268 1798 aa22.33■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 CA12O43570 354 aa22.33■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 RGS19P49795 217 aa22.33■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.33■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.33■■□□□ 1.17
FCHO1-229ENST00000599766 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.33■■□□□ 1.16
FCHO1-229ENST00000599766 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
FCHO1-229ENST00000599766 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
FCHO1-229ENST00000599766 NFE2L2Q16236 605 aa22.32■■□□□ 1.16
FCHO1-229ENST00000599766 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
FCHO1-229ENST00000599766 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
FCHO1-229ENST00000599766 TSKSQ9UJT2 592 aa22.32■■□□□ 1.16
FCHO1-229ENST00000599766 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.32■■□□□ 1.16
FCHO1-229ENST00000599766 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.31■■□□□ 1.16
FCHO1-229ENST00000599766 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.31■■□□□ 1.16
FCHO1-229ENST00000599766 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
FCHO1-229ENST00000599766 BBOX1O75936 387 aa22.3■■□□□ 1.16
FCHO1-229ENST00000599766 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.3■■□□□ 1.16
FCHO1-229ENST00000599766 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms