RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 UBR1Q8IWV7 1749 aa8.4□□□□□ -1.07
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HERC3-212ENST00000597259 TSPY4P0CV99 314 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-212ENST00000597259 TSPY10P0CW01 314 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-212ENST00000597259 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HERC3-212ENST00000597259 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
HERC3-212ENST00000597259 ADGRL2O95490 1459 aa8.38□□□□□ -1.07
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HERC3-212ENST00000597259 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
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HERC3-212ENST00000597259 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
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HERC3-212ENST00000597259 UGGT1Q9NYU2 1555 aa8.36□□□□□ -1.07
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HERC3-212ENST00000597259 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
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HERC3-212ENST00000597259 CFHR5Q9BXR6 569 aa8.36□□□□□ -1.07
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HERC3-212ENST00000597259 IQGAP1P46940 1657 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-212ENST00000597259 ARHGAP23Q9P227 1491 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-212ENST00000597259 KRBA1A5PL33 1030 aa8.35□□□□□ -1.07
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HERC3-212ENST00000597259 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
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HERC3-212ENST00000597259 CPS1P31327 1500 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-212ENST00000597259 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
HERC3-212ENST00000597259 SOCS7O14512 581 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-212ENST00000597259 BNIP3LO60238 219 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-212ENST00000597259 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.29□□□□□ -1.08
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HERC3-212ENST00000597259 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
HERC3-212ENST00000597259 PGBD3Q8N328 593 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-212ENST00000597259 POM121Q96HA1 1249 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-212ENST00000597259 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-212ENST00000597259 IQGAP3Q86VI3 1631 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-212ENST00000597259 LRRC7Q96NW7 1537 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-212ENST00000597259 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-212ENST00000597259 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
HERC3-212ENST00000597259 FGFR3P22607 806 aa8.28□□□□□ -1.08
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