RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592826.1

APBA3-208, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family A member 3, human

TSL 2

Gene APBA3, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBA3-208	ENST00000592826	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		28.79	■■■□□ 2.2
APBA3-208	ENST00000592826	TTLL6	Q8N841	843 aa		28.79	■■■□□ 2.2
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF428	Q96B54	188 aa		28.79	■■■□□ 2.2
APBA3-208	ENST00000592826	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		28.79	■■■□□ 2.2
APBA3-208	ENST00000592826	STYK1	Q6J9G0	422 aa		28.78	■■■□□ 2.2
APBA3-208	ENST00000592826	KSR2	Q6VAB6	950 aa		28.78	■■■□□ 2.2
APBA3-208	ENST00000592826	MASTL	Q96GX5	879 aa		28.78	■■■□□ 2.2
APBA3-208	ENST00000592826	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		28.77	■■■□□ 2.2
APBA3-208	ENST00000592826	SRGN	P10124	158 aa		28.77	■■■□□ 2.2
APBA3-208	ENST00000592826	CNKSR1	Q969H4	720 aa		28.77	■■■□□ 2.2
APBA3-208	ENST00000592826	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		28.77	■■■□□ 2.2
APBA3-208	ENST00000592826	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		28.76	■■■□□ 2.2
APBA3-208	ENST00000592826	ERFE	Q4G0M1	354 aa		28.76	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		28.76	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		28.76	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		28.76	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	NPR1	P16066	1061 aa		28.75	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	FLII	Q13045	1269 aa		28.75	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	28.75	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		28.75	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	28.74	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		28.74	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		28.73	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		28.73	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		28.73	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		28.73	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		28.73	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		28.73	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	CRY2	Q49AN0	593 aa		28.72	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	NLRP3	Q96P20	1036 aa		28.72	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		28.71	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		28.71	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	ALDH1B1	P30837	517 aa		28.71	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	IFFO2	Q5TF58	517 aa		28.71	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	G2E3	Q7L622	706 aa		28.71	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	MYD88	Q99836	296 aa		28.71	■■■□□ 2.19
APBA3-208	ENST00000592826	TOMM70	O94826	608 aa		28.7	■■■□□ 2.18
APBA3-208	ENST00000592826	ABCC12	Q96J65	1359 aa		28.7	■■■□□ 2.18
APBA3-208	ENST00000592826	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
APBA3-208	ENST00000592826	APLP1	P51693	650 aa		28.67	■■■□□ 2.18
APBA3-208	ENST00000592826	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		28.67	■■■□□ 2.18
APBA3-208	ENST00000592826	SOGA3	Q5TF21	947 aa		28.67	■■■□□ 2.18
APBA3-208	ENST00000592826	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
APBA3-208	ENST00000592826	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
APBA3-208	ENST00000592826	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		28.66	■■■□□ 2.18
APBA3-208	ENST00000592826	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
APBA3-208	ENST00000592826	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		28.65	■■■□□ 2.18
APBA3-208	ENST00000592826	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
APBA3-208	ENST00000592826	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
APBA3-208	ENST00000592826	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.18
APBA3-208	ENST00000592826	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
APBA3-208	ENST00000592826	FAM89A	Q96GI7	184 aa		28.63	■■■□□ 2.17
APBA3-208	ENST00000592826	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		28.63	■■■□□ 2.17
APBA3-208	ENST00000592826	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		28.63	■■■□□ 2.17
APBA3-208	ENST00000592826	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		28.63	■■■□□ 2.17
APBA3-208	ENST00000592826	IGKV5-2	P06315	115 aa		28.61	■■■□□ 2.17
APBA3-208	ENST00000592826	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
APBA3-208	ENST00000592826	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
APBA3-208	ENST00000592826	LINS1	Q8NG48	757 aa		28.61	■■■□□ 2.17
APBA3-208	ENST00000592826	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
APBA3-208	ENST00000592826	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		28.6	■■■□□ 2.17
APBA3-208	ENST00000592826	PTPRC	P08575	1304 aa		28.6	■■■□□ 2.17
APBA3-208	ENST00000592826	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		28.6	■■■□□ 2.17
APBA3-208	ENST00000592826	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
APBA3-208	ENST00000592826	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		28.59	■■■□□ 2.17
APBA3-208	ENST00000592826	C21orf2	O43822	256 aa		28.59	■■■□□ 2.17
APBA3-208	ENST00000592826	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
APBA3-208	ENST00000592826	SYNE4	Q8N205	404 aa		28.59	■■■□□ 2.17
APBA3-208	ENST00000592826	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
APBA3-208	ENST00000592826	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
APBA3-208	ENST00000592826	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		28.58	■■■□□ 2.17
APBA3-208	ENST00000592826	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		28.58	■■■□□ 2.17
APBA3-208	ENST00000592826	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		28.58	■■■□□ 2.17
APBA3-208	ENST00000592826	RNF181	Q9P0P0	153 aa		28.58	■■■□□ 2.17
APBA3-208	ENST00000592826	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
APBA3-208	ENST00000592826	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
APBA3-208	ENST00000592826	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		28.57	■■■□□ 2.16
APBA3-208	ENST00000592826	SBF1	O95248	1867 aa		28.57	■■■□□ 2.16
APBA3-208	ENST00000592826	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		28.56	■■■□□ 2.16
APBA3-208	ENST00000592826	SLX4	Q8IY92	1834 aa		28.55	■■■□□ 2.16
APBA3-208	ENST00000592826	BBOX1	O75936	387 aa		28.55	■■■□□ 2.16
APBA3-208	ENST00000592826	GCKR	Q14397	625 aa		28.55	■■■□□ 2.16
APBA3-208	ENST00000592826	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
APBA3-208	ENST00000592826	CCDC93	Q567U6	631 aa		28.55	■■■□□ 2.16
APBA3-208	ENST00000592826	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		28.55	■■■□□ 2.16
APBA3-208	ENST00000592826	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		28.55	■■■□□ 2.16
APBA3-208	ENST00000592826	PDE8A	O60658	829 aa		28.54	■■■□□ 2.16
APBA3-208	ENST00000592826	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	28.54	■■■□□ 2.16
APBA3-208	ENST00000592826	BEND3	Q5T5X7	828 aa		28.54	■■■□□ 2.16
APBA3-208	ENST00000592826	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	28.54	■■■□□ 2.16
APBA3-208	ENST00000592826	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		28.53	■■■□□ 2.16
APBA3-208	ENST00000592826		F6X3S4	739 aa		28.53	■■■□□ 2.16
APBA3-208	ENST00000592826		H7C1W4	665 aa		28.53	■■■□□ 2.16
APBA3-208	ENST00000592826	TMC4	Q7Z404	712 aa		28.53	■■■□□ 2.16

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