RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589497.5

GIPC1-210, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene GIPC1, Length 853 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-210ENST00000589497 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
GIPC1-210ENST00000589497 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa24.27■■□□□ 1.48
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GIPC1-210ENST00000589497 SLC4A2P04920 1241 aa24.26■■□□□ 1.47
GIPC1-210ENST00000589497 C9orf131Q5VYM1 1079 aa24.26■■□□□ 1.47
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
GIPC1-210ENST00000589497 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
GIPC1-210ENST00000589497 RNF181Q9P0P0 153 aa24.25■■□□□ 1.47
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GIPC1-210ENST00000589497 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.25■■□□□ 1.47
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF428Q96B54 188 aa24.24■■□□□ 1.47
GIPC1-210ENST00000589497 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.24■■□□□ 1.47
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GIPC1-210ENST00000589497 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.23■■□□□ 1.47
GIPC1-210ENST00000589497 MYD88Q99836 296 aa24.23■■□□□ 1.47
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GIPC1-210ENST00000589497 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
GIPC1-210ENST00000589497 DLEC1Q9Y238 1755 aa24.23■■□□□ 1.47
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GIPC1-210ENST00000589497 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.22■■□□□ 1.47
GIPC1-210ENST00000589497 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
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GIPC1-210ENST00000589497 CRY2Q49AN0 593 aa24.21■■□□□ 1.47
GIPC1-210ENST00000589497 KSR2Q6VAB6 950 aa24.21■■□□□ 1.47
GIPC1-210ENST00000589497 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
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GIPC1-210ENST00000589497 E9PSI1 815 aa24.19■■□□□ 1.46
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GIPC1-210ENST00000589497 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
GIPC1-210ENST00000589497 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.19■■□□□ 1.46
GIPC1-210ENST00000589497 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
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GIPC1-210ENST00000589497 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.18■■□□□ 1.46
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF521Q96K83 1311 aa24.17■■□□□ 1.46
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GIPC1-210ENST00000589497 SYNE4Q8N205 404 aa24.17■■□□□ 1.46
GIPC1-210ENST00000589497 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.17■■□□□ 1.46
GIPC1-210ENST00000589497 ADCY9O60503 1353 aa24.16■■□□□ 1.46
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GIPC1-210ENST00000589497 G2E3Q7L622 706 aa24.16■■□□□ 1.46
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GIPC1-210ENST00000589497 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
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GIPC1-210ENST00000589497 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.11■■□□□ 1.45
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GIPC1-210ENST00000589497 CACNA1SQ13698 1873 aa24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-210ENST00000589497 BBOX1O75936 387 aa24.11■■□□□ 1.45
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GIPC1-210ENST00000589497 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
GIPC1-210ENST00000589497 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.07■■□□□ 1.44
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GIPC1-210ENST00000589497 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
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GIPC1-210ENST00000589497 TMC4Q7Z404 712 aa24.04■■□□□ 1.44
GIPC1-210ENST00000589497 SP8Q8IXZ3 490 aa24.04■■□□□ 1.44
GIPC1-210ENST00000589497 LINS1Q8NG48 757 aa24.04■■□□□ 1.44
GIPC1-210ENST00000589497 PSMD1Q99460 953 aa24.04■■□□□ 1.44
GIPC1-210ENST00000589497 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa24.03■■□□□ 1.44
GIPC1-210ENST00000589497 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
GIPC1-210ENST00000589497 C1QTNF8P60827 252 aa24.03■■□□□ 1.44
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