RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TJP1Q07157 1748 aa19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KLHDC4Q8TBB5 520 aa19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SIL1Q9H173 461 aa19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IL2RBP14784 551 aa19.91■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CASP7P55210 303 aa19.91■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARXQ96QS3 562 aa19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TNS2Q63HR2 1409 aa19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NBPF26B4DH59 902 aa19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NBPF14Q5TI25 921 aa19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GAS2L3Q86XJ1 694 aa19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NBPF15Q8N660 670 aa19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC171Q6TFL3 1326 aa19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A087WZG4 1122 aa19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PTH1RQ03431 593 aa19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PANK2Q9BZ23 570 aa19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TM6SF1Q9BZW5 370 aa19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AK2P54819 239 aa19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NECTIN1Q15223 517 aa19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM43AQ8N2R8 423 aa19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 H7C1W4 665 aa19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BOLA2Q9H3K6 86 aa19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TNNI3KQ59H18 835 aa19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MAP4K1Q92918 833 aa19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TCHHQ07283 1943 aa19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MED23Q9ULK4 1368 aa19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATP5JP18859 108 aa19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CASTP20810 708 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF445P59923 1031 aa19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM227BQ96M60 508 aa19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RFX7Q2KHR2 1363 aa19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 JCADQ9P266 1359 aa19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 VPS53Q5VIR6 699 aa19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RUFY3Q7L099 469 aa19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FSD1Q9BTV5 496 aa19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TFCP2Q12800 502 aa19.84■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FOXO4P98177 505 aa19.83■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TTLL7Q6ZT98 887 aa19.83■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPT2Q8TD30 523 aa19.83■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ADCK5Q3MIX3 580 aa19.83■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ITGB4P16144 1822 aa19.83■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A0D9SFI3 127 aa19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A1BGP04217 495 aa19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CREB3L3Q68CJ9 461 aa19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LMBR1LQ6UX01 489 aa19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC191Q8NCU4 936 aa19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EVA1CP58658 441 aa19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 STRN4Q9NRL3 753 aa19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PDRG1Q9NUG6 133 aa19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MBD3O95983 291 aa19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CPA1P15085 419 aa19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NCLP19338 710 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CHAMP1Q96JM3 812 aa19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPR108Q9NPR9 543 aa19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC27A2O14975 620 aa19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PSMA5P28066 241 aa19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RNF20Q5VTR2 975 aa19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HAUS7Q99871 368 aa19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KCNJ4P48050 445 aa19.78■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TSGA10IPQ3SY00 556 aa19.78■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DBNDD2Q9BQY9 259 aa19.78■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HMG20BQ9P0W2 317 aa19.78■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPEF2Q9C093 1822 aa19.77■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LARGE1O95461 756 aa19.77■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATG9AQ7Z3C6 839 aa19.77■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZBTB3Q9H5J0 574 aa19.77■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATG3Q9NT62 314 aa19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms