RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
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GGA3-211ENST00000582232 NFIXQ14938 502 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-211ENST00000582232 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
GGA3-211ENST00000582232 USP44Q9H0E7 712 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-211ENST00000582232 NRXN2Q9P2S2 1712 aa14.52□□□□□ -0.09
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GGA3-211ENST00000582232 HDAC5Q9UQL6 1122 aa14.49□□□□□ -0.09
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GGA3-211ENST00000582232 NLRP3Q96P20 1036 aa14.4□□□□□ -0.1
GGA3-211ENST00000582232 SPON1Q9HCB6 807 aa14.4□□□□□ -0.1
GGA3-211ENST00000582232 C10orf71Q711Q0 1435 aa14.4□□□□□ -0.1
GGA3-211ENST00000582232 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
GGA3-211ENST00000582232 NPHP1O15259 732 aa14.39□□□□□ -0.11
GGA3-211ENST00000582232 ATP8B2P98198 1209 aa14.39□□□□□ -0.11
GGA3-211ENST00000582232 CRY2Q49AN0 593 aa14.39□□□□□ -0.11
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