RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576346.5

NSF-208, Transcript of N-ethylmaleimide sensitive factor, vesicle fusing ATPase, human

TSL 4

Gene NSF, Length 710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSF-208	ENST00000576346	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	TESK2	Q96S53	571 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	FANCA	O15360	1455 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	MYOM1	P52179	1685 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	IFT172	Q9UG01	1749 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	TTLL8	A6PVC2	850 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	GDF11	O95390	407 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	FBXO45	P0C2W1	286 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	ERFE	Q4G0M1	354 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	GLMN	Q92990	594 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	USP35	Q9P2H5	1018 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	ADGRB3	O60242	1522 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	AAMP	Q13685	434 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	ADAM32	Q8TC27	787 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	ABCA6	Q8N139	1617 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	ZMYM3	Q14202	1370 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	POM121C	A8CG34	1229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	ARID3A	Q99856	593 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	NSD2	O96028	1365 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	CD109	Q6YHK3	1445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	GPR37L1	O60883	481 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	IGHA1	P01876	353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	ITGA6	P23229	1130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	RGL3	Q3MIN7	710 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	RNF20	Q5VTR2	975 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	BCL11A	Q9H165	835 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	ALG2	Q9H553	416 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	PANK3	Q9H999	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	LRP5	O75197	1615 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	FOXK2	Q01167	660 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	CBLB	Q13191	982 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	KANK3	Q6NY19	840 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	WHAMM	Q8TF30	809 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	ERVK-7	P63135	1459 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	PPL	O60437	1756 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346		E9PSI1	815 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	PPP2R1A	P30153	589 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	CCDC125	Q86Z20	511 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	BACH2	Q9BYV9	841 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	CPS1	P31327	1500 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	MROH2A	A6NES4	1674 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	NEO1	Q92859	1461 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	RNF135	Q8IUD6	432 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSF-208	ENST00000576346	PIK3C2B	O00750	1634 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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