RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574157.5

NOMO3-211, Transcript of NODAL modulator 3, human

TSL 3

Gene NOMO3, Length 821 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NOMO3-211	ENST00000574157	ZNF827	Q17R98	1081 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	UTRN	P46939	3433 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157		A0A087WZG4	1122 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	USP44	Q9H0E7	712 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	RPS6KA4	O75676	772 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	GRM8	O00222	908 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	CAMTA2	O94983	1202 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	GNAI2	P04899	355 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	KCNQ4	P56696	695 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	TCIRG1	Q13488	830 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	GCKR	Q14397	625 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	MYD88	Q99836	296 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	NUP98	P52948	1817 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	LAMB2	P55268	1798 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	MTX1	Q13505	466 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	CEP85	Q6P2H3	762 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	SSFA2	P28290	1259 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	CASP7	P55210	303 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	IFFO2	Q5TF58	517 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	SMC5	Q8IY18	1101 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	GNPAT	O15228	680 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	MSL1	Q68DK7	614 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	AK7	Q96M32	723 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	NARF	Q9UHQ1	456 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157		H7C1W4	665 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	GRIN3B	O60391	1043 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	HMMR	O75330	724 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	IGHD	P01880	384 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	PARP10	Q53GL7	1025 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	NLRP10	Q86W26	655 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	HLF	Q16534	295 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	SSH3	Q8TE77	659 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	GCC1	Q96CN9	775 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	KAZALD1	Q96I82	304 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	ATP8B2	P98198	1209 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	SUCLG2	Q96I99	432 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NOMO3-211	ENST00000574157	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	11.2	□□□□□ -0.62
NOMO3-211	ENST00000574157	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NOMO3-211	ENST00000574157	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NOMO3-211	ENST00000574157	DCTPP1	Q9H773	170 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NOMO3-211	ENST00000574157	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NOMO3-211	ENST00000574157	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
NOMO3-211	ENST00000574157	NTSR2	O95665	410 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NOMO3-211	ENST00000574157	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NOMO3-211	ENST00000574157	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NOMO3-211	ENST00000574157	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
NOMO3-211	ENST00000574157	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62

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