RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566306.5

DUS2-209, Transcript of dihydrouridine synthase 2, human

TSL 4

Gene DUS2, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DUS2-209	ENST00000566306	CNTROB	Q8N137	903 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DUS2-209	ENST00000566306	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
DUS2-209	ENST00000566306	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DUS2-209	ENST00000566306	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	BTBD11	A6QL63	1104 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	FZD9	O00144	591 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	NPHP1	O15259	732 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	NPR1	P16066	1061 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	SLX4	Q8IY92	1834 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	RGL2	O15211	777 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	ANP32C	O43423	234 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	GPC2	Q8N158	579 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	A1BG	P04217	495 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	MCM10	Q7L590	875 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	RUNDC1	Q96C34	613 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	ALDH1B1	P30837	517 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	11.24	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	ECE1	P42892	770 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	SYNE4	Q8N205	404 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	PSMD1	Q99460	953 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	RIPK4	P57078	832 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	DCTN1	Q14203	1278 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	SNED1	Q8TER0	1413 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	JDP2	Q8WYK2	163 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	MAP2K2	P36507	400 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	OLFM4	Q6UX06	510 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	CAPNS2	Q96L46	248 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	USP16	Q9Y5T5	823 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DUS2-209	ENST00000566306	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		11.21	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	CA12	O43570	354 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	CRY2	Q49AN0	593 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	CST9	Q5W186	159 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	KCNQ3	O43525	872 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	SCNN1D	P51172	638 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	MRS2	Q9HD23	443 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	FBXO3	Q9UK99	471 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	11.19	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	CACNA1S	Q13698	1873 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	ERBB4	Q15303	1308 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	EPS15	P42566	896 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	LTBP1	Q14766	1721 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	NBPF26	B4DH59	902 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	NEUROD2	Q15784	382 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	NBPF15	Q8N660	670 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	NYX	Q9GZU5	481 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	VPS33B	Q9H267	617 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DUS2-209	ENST00000566306	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		11.16	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms