RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	RNF20	Q5VTR2	975 aa		22.05	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	22.05	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		22.04	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	OFD1	O75665	1012 aa		22.04	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	22.04	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	22.04	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	22.04	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	GCKR	Q14397	625 aa		22.04	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	UVSSA	Q2YD98	709 aa		22.04	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		22.04	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	22.04	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		22.04	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	ABCC6	O95255	1503 aa		22.04	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	TPM2	P07951	284 aa		22.03	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		22.03	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		22.03	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		22.03	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	RGPD5	Q99666	1765 aa		22.03	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	MRC1	P22897	1456 aa		22.03	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	CPA1	P15085	419 aa		22.03	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	PHKG2	P15735	406 aa		22.03	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	GJB2	P29033	226 aa		22.03	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	22.03	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD1	Q15327	319 aa		22.03	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		22.03	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	22.03	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		22.03	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	RNF214	Q8ND24	703 aa		22.02	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	FSD1	Q9BTV5	496 aa		22.02	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		22.02	■■□□□ 1.12
RRN3-205	ENST00000563559	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	22.02	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		22.01	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		22.01	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	22.01	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	ALS2	Q96Q42	1657 aa		22.01	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	22.01	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	SLC39A6	Q13433	755 aa		22.01	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		22.01	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	FAM227B	Q96M60	508 aa		22.01	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	22.01	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	LARGE1	O95461	756 aa		22	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	22	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	MYL6B	P14649	208 aa		22	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	TERF1	P54274	439 aa		22	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		22	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	COPS6	Q7L5N1	327 aa		22	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	COPRS	Q9NQ92	184 aa		22	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		22	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	MTMR6	Q9Y217	621 aa		22	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	SLC27A2	O14975	620 aa		22	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	MYD88	Q99836	296 aa		22	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	SIL1	Q9H173	461 aa		22	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	COL15A1	P39059	1388 aa		21.99	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	C5	P01031	1676 aa		21.99	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	PDC	P20941	246 aa		21.99	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		21.99	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		21.99	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	ME3	Q16798	604 aa		21.98	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	DCAF5	Q96JK2	942 aa		21.98	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	MED23	Q9ULK4	1368 aa		21.98	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		21.98	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	21.98	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		21.97	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	21.97	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	21.97	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0D9SFI3	127 aa		21.97	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	FIBP	O43427	364 aa		21.97	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	ATP5J	P18859	108 aa		21.97	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		21.97	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	21.97	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	JCAD	Q9P266	1359 aa		21.97	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		21.96	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	KRT32	Q14532	448 aa		21.95	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		21.95	■■□□□ 1.11
RRN3-205	ENST00000563559	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	21.95	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	21.94	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	ATF3	P18847	181 aa		21.94	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	RPS6KB1	P23443	525 aa		21.94	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		21.94	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	21.94	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		21.94	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	MEGF6	O75095	1541 aa		21.94	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	21.94	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		21.94	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	21.94	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		21.94	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	ST3GAL1	Q11201	340 aa		21.93	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	TNNI3K	Q59H18	835 aa		21.93	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		21.93	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	21.92	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	21.92	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		21.92	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	KRT85	P78386	507 aa		21.92	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	NECAB1	Q8N987	351 aa		21.92	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	USP16	Q9Y5T5	823 aa		21.92	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	21.91	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	TAF5L	O75529	589 aa		21.91	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	DCC	P43146	1447 aa		21.91	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	COL18A1	P39060	1754 aa		21.91	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	21.91	■■□□□ 1.1

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms