RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560067.1

USP3-AS1-205, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 366 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-205ENST00000560067 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 RNF123Q5XPI4 1314 aa15.92■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa15.91■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLC4A2P04920 1241 aa15.91■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 CRY2Q49AN0 593 aa15.91■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLC10A5Q5PT55 438 aa15.91■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 SOGA3Q5TF21 947 aa15.91■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 ISCA1Q9BUE6 129 aa15.91■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 CHD4Q14839 1912 aa15.91■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 SH3TC1Q8TE82 1336 aa15.91■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 VAMP4O75379 141 aa15.9■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 RNF181Q9P0P0 153 aa15.9■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF521Q96K83 1311 aa15.9■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 RASSF7Q02833 373 aa15.89■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 MIER1Q8N108 512 aa15.89■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF428Q96B54 188 aa15.89■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 MYD88Q99836 296 aa15.89■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 ADCY9O60503 1353 aa15.88■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 RIC1Q4ADV7 1423 aa15.88■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 LMNB1P20700 586 aa15.88■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 KSR2Q6VAB6 950 aa15.88■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 NUP98P52948 1817 aa15.88■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa15.88■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 PI4KAP2A4QPH2 592 aa15.87■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 E9PSI1 815 aa15.87■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 NFKBIEO00221 500 aa15.87■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 CCDC93Q567U6 631 aa15.87■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 C3orf67Q6ZVT6 689 aa15.87■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 SYNE4Q8N205 404 aa15.87■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa15.87■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 C7orf43Q8WVR3 580 aa15.87■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAM89AQ96GI7 184 aa15.87■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 CRAMP1Q96RY5 1269 aa15.87■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa15.87■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 G2E3Q7L622 706 aa15.86■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 TAOK3Q9H2K8 898 aa15.86■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa15.85■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 NEXNQ0ZGT2 675 aa15.85■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 FLIIQ13045 1269 aa15.85■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 RTKN2Q8IZC4 609 aa15.85■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 CCDC191Q8NCU4 936 aa15.85■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 DLEC1Q9Y238 1755 aa15.85■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-205ENST00000560067 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 PRELPP51888 382 aa15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLFN5Q08AF3 891 aa15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 OLFM4Q6UX06 510 aa15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 LTBP3Q9NS15 1303 aa15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 GRIPAP1Q4V328 841 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 BBOX1O75936 387 aa15.81■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 IGKV5-2P06315 115 aa15.81■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 KDM2BQ8NHM5 1336 aa15.81■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 DNAAF4Q8WXU2 420 aa15.81■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 CDCA7LQ96GN5 454 aa15.81■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLX4Q8IY92 1834 aa15.8■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 ABCC4O15439 1325 aa15.8■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 GRAPQ13588 217 aa15.8■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa15.8■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 NEURL1BA8MQ27 555 aa15.79■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 PDE8AO60658 829 aa15.78■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 DPY19L2Q6NUT2 758 aa15.78■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMC4Q7Z404 712 aa15.78■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 LINS1Q8NG48 757 aa15.78■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 PSMD1Q99460 953 aa15.78■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa15.77■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 GLTPD2A6NH11 291 aa15.77■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 SP8Q8IXZ3 490 aa15.77■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 NMRK2Q9NPI5 230 aa15.77■□□□□ 0.12
USP3-AS1-205ENST00000560067 CDHR2Q9BYE9 1310 aa15.76■□□□□ 0.11
USP3-AS1-205ENST00000560067 F6X3S4 739 aa15.76■□□□□ 0.11
USP3-AS1-205ENST00000560067 IARSP41252 1262 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
USP3-AS1-205ENST00000560067 C1QTNF8P60827 252 aa15.76■□□□□ 0.11
USP3-AS1-205ENST00000560067 GCKRQ14397 625 aa15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms