RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559359.1

PSME2-208, Transcript of proteasome activator subunit 2, human

TSL 2

Gene PSME2, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME2-208	ENST00000559359	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PSME2-208	ENST00000559359	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PSME2-208	ENST00000559359	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PSME2-208	ENST00000559359	TK2	O00142	265 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PSME2-208	ENST00000559359	KCNQ3	O43525	872 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PSME2-208	ENST00000559359	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PSME2-208	ENST00000559359	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PSME2-208	ENST00000559359		A0A0G2JLW4	131 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	PTPRE	P23469	700 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	DDR1	Q08345	913 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	DCTN1	Q14203	1278 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	ZNF790	Q6PG37	636 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	ZPR1	O75312	459 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	FCHSD2	O94868	740 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	MCM10	Q7L590	875 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	COL15A1	P39059	1388 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	BTBD11	A6QL63	1104 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	STARD3NL	O95772	234 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	DPEP1	P16444	411 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	PDIA6	Q15084	440 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	NARF	Q9UHQ1	456 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	BCS1L	Q9Y276	419 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	TM4SF1	P30408	202 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	TGFB2	P61812	414 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	FBXW7	Q969H0	707 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	A1BG	P04217	495 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	NFIX	Q14938	502 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PSME2-208	ENST00000559359	CHRNA5	P30532	468 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	ATP10D	Q9P241	1426 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	NEFM	P07197	916 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	KCNA3	P22001	575 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	PLCB2	Q00722	1185 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	EPAS1	Q99814	870 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	USP16	Q9Y5T5	823 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359		A0A087WZG4	1122 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	HR	O43593	1189 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	SERPINB2	P05120	415 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	RALBP1	Q15311	655 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	DDX12P	Q92771	950 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	NFE2L2	Q16236	605 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	PIM2	Q9P1W9	311 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	C1QTNF8	P60827	252 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	ADCY9	O60503	1353 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PSME2-208	ENST00000559359	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	NBPF26	B4DH59	902 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	CAMTA2	O94983	1202 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	NBPF15	Q8N660	670 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21

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