RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559259.1

MFGE8-210, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 611 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-210ENST00000559259 UTRNP46939 3433 aa22.8■■□□□ 1.24
MFGE8-210ENST00000559259 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.8■■□□□ 1.24
MFGE8-210ENST00000559259 CAMTA2O94983 1202 aa22.8■■□□□ 1.24
MFGE8-210ENST00000559259 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.8■■□□□ 1.24
MFGE8-210ENST00000559259 BCORQ6W2J9 1755 aa22.79■■□□□ 1.24
MFGE8-210ENST00000559259 GCKRQ14397 625 aa22.79■■□□□ 1.24
MFGE8-210ENST00000559259 MEIS3Q99687 375 aa22.79■■□□□ 1.24
MFGE8-210ENST00000559259 NARFQ9UHQ1 456 aa22.79■■□□□ 1.24
MFGE8-210ENST00000559259 SCN7AQ01118 1682 aa22.78■■□□□ 1.24
MFGE8-210ENST00000559259 GRM8O00222 908 aa22.78■■□□□ 1.24
MFGE8-210ENST00000559259 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.77■■□□□ 1.24
MFGE8-210ENST00000559259 GNAI2P04899 355 aa22.77■■□□□ 1.24
MFGE8-210ENST00000559259 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
MFGE8-210ENST00000559259 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
MFGE8-210ENST00000559259 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.77■■□□□ 1.24
MFGE8-210ENST00000559259 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
MFGE8-210ENST00000559259 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.77■■□□□ 1.24
MFGE8-210ENST00000559259 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.76■■□□□ 1.23
MFGE8-210ENST00000559259 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
MFGE8-210ENST00000559259 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.76■■□□□ 1.23
MFGE8-210ENST00000559259 YY1P25490 414 aa22.75■■□□□ 1.23
MFGE8-210ENST00000559259 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.75■■□□□ 1.23
MFGE8-210ENST00000559259 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
MFGE8-210ENST00000559259 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
MFGE8-210ENST00000559259 HLFQ16534 295 aa22.74■■□□□ 1.23
MFGE8-210ENST00000559259 PARP10Q53GL7 1025 aa22.74■■□□□ 1.23
MFGE8-210ENST00000559259 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
MFGE8-210ENST00000559259 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.74■■□□□ 1.23
MFGE8-210ENST00000559259 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
MFGE8-210ENST00000559259 H7C1W4 665 aa22.73■■□□□ 1.23
MFGE8-210ENST00000559259 ZPR1O75312 459 aa22.73■■□□□ 1.23
MFGE8-210ENST00000559259 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
MFGE8-210ENST00000559259 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.72■■□□□ 1.23
MFGE8-210ENST00000559259 RFC4P35249 363 aa22.72■■□□□ 1.23
MFGE8-210ENST00000559259 NLRP10Q86W26 655 aa22.72■■□□□ 1.23
MFGE8-210ENST00000559259 NUP98P52948 1817 aa22.72■■□□□ 1.23
MFGE8-210ENST00000559259 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
MFGE8-210ENST00000559259 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.71■■□□□ 1.23
MFGE8-210ENST00000559259 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
MFGE8-210ENST00000559259 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 CASP7P55210 303 aa22.7■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 MTX1Q13505 466 aa22.7■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.69■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.69■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 CEP85Q6P2H3 762 aa22.69■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.69■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.68■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 HMMRO75330 724 aa22.68■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 MMP10P09238 476 aa22.68■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 GYS1P13807 737 aa22.68■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 GPR162Q16538 588 aa22.68■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.68■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.68■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.68■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.67■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.67■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 ATP8B2P98198 1209 aa22.66■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.66■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.66■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.65■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.65■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
MFGE8-210ENST00000559259 GPTP24298 496 aa22.64■■□□□ 1.21
MFGE8-210ENST00000559259 SUCLG2Q96I99 432 aa22.64■■□□□ 1.21
MFGE8-210ENST00000559259 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
MFGE8-210ENST00000559259 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.63■■□□□ 1.21
MFGE8-210ENST00000559259 SSH3Q8TE77 659 aa22.63■■□□□ 1.21
MFGE8-210ENST00000559259 KAZALD1Q96I82 304 aa22.63■■□□□ 1.21
MFGE8-210ENST00000559259 NYXQ9GZU5 481 aa22.63■■□□□ 1.21
MFGE8-210ENST00000559259 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.62■■□□□ 1.21
MFGE8-210ENST00000559259 NTSR2O95665 410 aa22.62■■□□□ 1.21
MFGE8-210ENST00000559259 IGHDP01880 384 aa22.62■■□□□ 1.21
MFGE8-210ENST00000559259 POLA2Q14181 598 aa22.62■■□□□ 1.21
MFGE8-210ENST00000559259 SMC5Q8IY18 1101 aa22.62■■□□□ 1.21
MFGE8-210ENST00000559259 GCC1Q96CN9 775 aa22.62■■□□□ 1.21
MFGE8-210ENST00000559259 SETDB2Q96T68 719 aa22.62■■□□□ 1.21
MFGE8-210ENST00000559259 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
MFGE8-210ENST00000559259 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.62■■□□□ 1.21
MFGE8-210ENST00000559259 SUSD4Q5VX71 490 aa22.61■■□□□ 1.21
MFGE8-210ENST00000559259 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.61■■□□□ 1.21
MFGE8-210ENST00000559259 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.61■■□□□ 1.21
MFGE8-210ENST00000559259 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.61■■□□□ 1.21
MFGE8-210ENST00000559259 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
MFGE8-210ENST00000559259 DCTPP1Q9H773 170 aa22.6■■□□□ 1.21
MFGE8-210ENST00000559259 FOXO4P98177 505 aa22.59■■□□□ 1.21
MFGE8-210ENST00000559259 DDR1Q08345 913 aa22.59■■□□□ 1.21
MFGE8-210ENST00000559259 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.58■■□□□ 1.21
MFGE8-210ENST00000559259 TM4SF1P30408 202 aa22.58■■□□□ 1.21
MFGE8-210ENST00000559259 FAM89AQ96GI7 184 aa22.58■■□□□ 1.21
MFGE8-210ENST00000559259 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms