RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559061.5

SNX1-204, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 5

Gene SNX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-204ENST00000559061 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SNX1-204ENST00000559061 MYD88Q99836 296 aa14.67□□□□□ -0.06
SNX1-204ENST00000559061 TAF1P21675 1872 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX1-204ENST00000559061 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SNX1-204ENST00000559061 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SNX1-204ENST00000559061 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SNX1-204ENST00000559061 RIC3Q7Z5B4 369 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX1-204ENST00000559061 WWC3Q9ULE0 1092 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX1-204ENST00000559061 SLX4Q8IY92 1834 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX1-204ENST00000559061 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SNX1-204ENST00000559061 TGFB2P61812 414 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX1-204ENST00000559061 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SNX1-204ENST00000559061 ALDH1L2Q3SY69 923 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX1-204ENST00000559061 PARP10Q53GL7 1025 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX1-204ENST00000559061 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX1-204ENST00000559061 SLC51AQ86UW1 340 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX1-204ENST00000559061 BRIP1Q9BX63 1249 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX1-204ENST00000559061 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX1-204ENST00000559061 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 TNNQ9UQP3 1299 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 BCAR3O75815 825 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 DDX58O95786 925 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 CASP7P55210 303 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 CRY2Q49AN0 593 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 SLC10A5Q5PT55 438 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 BEND3Q5T5X7 828 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 MYH3P11055 1940 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 SRGNP10124 158 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 ST5P78524 1137 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 C2CD5Q86YS7 1000 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 SNED1Q8TER0 1413 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 FAM89AQ96GI7 184 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 NYXQ9GZU5 481 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 SMC4Q9NTJ3 1288 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 CCDC191Q8NCU4 936 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 RNF123Q5XPI4 1314 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 SH3TC1Q8TE82 1336 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 LRRC37AA6NMS7 1700 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 PTPRCP08575 1304 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 PDE6BP35913 854 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 GCKRQ14397 625 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SNX1-204ENST00000559061 LINS1Q8NG48 757 aa14.59□□□□□ -0.07
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SNX1-204ENST00000559061 H7C1W4 665 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 CDHR2Q9BYE9 1310 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 LTBP1Q14766 1721 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 SPEF2Q9C093 1822 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 SBF1O95248 1867 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 H0YIN7 160 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 STYK1Q6J9G0 422 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 C7orf43Q8WVR3 580 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 PIM2Q9P1W9 311 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 ABCC4O15439 1325 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 TRIM27P14373 513 aa14.56□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 PRELPP51888 382 aa14.56□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 OLFM4Q6UX06 510 aa14.56□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 MASTLQ96GX5 879 aa14.56□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 KAZALD1Q96I82 304 aa14.56□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 CHD4Q14839 1912 aa14.56□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 A0A1B0GUL6 1792 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 NPHP1O15259 732 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 NPR1P16066 1061 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 NEXNQ0ZGT2 675 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 SLC4A10Q6U841 1118 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.081e-9■□□□□ 9.2
SNX1-204ENST00000559061 BCS1LQ9Y276 419 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 UTYO14607 1347 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 ALDH1L1O75891 902 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 RLBP1P12271 317 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 GPR162Q16538 588 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 TTLL6Q8N841 843 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 ARHGAP45Q92619 1136 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 KIF16BQ96L93 1317 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX1-204ENST00000559061 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
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