RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557061.5

PAPLN-210, Transcript of papilin, proteoglycan like sulfated glycoprotein, human

TSL 1 (best)

Gene PAPLN, Length 3,709 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPLN-210	ENST00000557061	GNAI3	P08754	354 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	ST18	O60284	1047 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	PKP1	Q13835	747 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	VAMP4	O75379	141 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	GORAB	Q5T7V8	394 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	SYCE3	A1L190	88 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	ATRN	O75882	1429 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	KCNJ4	P48050	445 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	NUCB1	Q02818	461 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	ST5	P78524	1137 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	MSL1	Q68DK7	614 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	ALS2	Q96Q42	1657 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	PTPRC	P08575	1304 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	ERBB4	Q15303	1308 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	LTN1	O94822	1766 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	CLCN1	P35523	988 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	KSR2	Q6VAB6	950 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	SMC5	Q8IY18	1101 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	ABCC6	O95255	1503 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	NYX	Q9GZU5	481 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	RPS6KA4	O75676	772 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	11.21	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	GCC1	Q96CN9	775 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	GNAI2	P04899	355 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	11.21	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	CNBD1	Q8NA66	436 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PAPLN-210	ENST00000557061	NLRP3	Q96P20	1036 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	ZNF853	P0CG23	659 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	MEIS3	Q99687	375 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	SHPRH	Q149N8	1683 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	PARP10	Q53GL7	1025 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	G2E3	Q7L622	706 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	LINS1	Q8NG48	757 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	11.2	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	NUCB2	P80303	420 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	VPS37D	Q86XT2	251 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	MCC	P23508	829 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	PLSCR1	O15162	318 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	ZBTB7A	O95365	584 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	ADRA2B	P18089	450 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	REC8	O95072	547 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	SDS	P20132	328 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PAPLN-210	ENST00000557061	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62

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