RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546997.1

BRF1-208, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 2

Gene BRF1, Length 1,999 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-208ENST00000546997 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 GNAI2P04899 355 aa20.3■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 GCKRQ14397 625 aa20.3■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 HLFQ16534 295 aa20.3■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 SMIM5Q71RC9 77 aa20.3■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 RRP9O43818 475 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 NUCB1Q02818 461 aa20.3■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 CEP85Q6P2H3 762 aa20.3■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 UBR3Q6ZT12 1888 aa20.29■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 GRM8O00222 908 aa20.29■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.29■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 C4AP0C0L4 1744 aa20.29■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 PROM2Q8N271 834 aa20.28■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 GNPATO15228 680 aa20.28■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 APBA3O96018 575 aa20.28■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 GCC1Q96CN9 775 aa20.28■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 UTYO14607 1347 aa20.28■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 TCIRG1Q13488 830 aa20.27■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 ANKRD44Q8N8A2 993 aa20.27■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 SCN7AQ01118 1682 aa20.27■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.27■□□□□ 0.84
BRF1-208ENST00000546997 SEC24BO95487 1268 aa20.26■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 MCM4P33991 863 aa20.26■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 MRE11P49959 708 aa20.26■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 SLC27A3Q5K4L6 730 aa20.26■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.26■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 TXNRD1Q16881 649 aa20.26■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.26■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 PLSCR1O15162 318 aa20.25■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 CAMTA2O94983 1202 aa20.25■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 CHD1LQ86WJ1 897 aa20.25■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.25■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 RPS6KA4O75676 772 aa20.25■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 KAZALD1Q96I82 304 aa20.25■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 A0A087WZG4 1122 aa20.24■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 GPTP24298 496 aa20.24■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa20.24■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.24■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.23■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 CCDC191Q8NCU4 936 aa20.23■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 SUCLG2Q96I99 432 aa20.23■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 LNPKQ9C0E8 428 aa20.23■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 CASP7P55210 303 aa20.22■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 AK7Q96M32 723 aa20.22■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.22■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.21■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.21■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.21■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 ATP8B2P98198 1209 aa20.21■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 NLRP10Q86W26 655 aa20.21■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
BRF1-208ENST00000546997 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.2■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 PHF14O94880 888 aa20.2■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 EPHA10Q5JZY3 1008 aa20.2■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 H7C1W4 665 aa20.19■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.19■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.19■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.19■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 MYH3P11055 1940 aa20.18■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 HMMRO75330 724 aa20.18■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 TMEM132AQ24JP5 1023 aa20.18■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 DCTPP1Q9H773 170 aa20.18■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 BCL2L12Q9HB09 334 aa20.18■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 NARFQ9UHQ1 456 aa20.18■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 SRGAP3O43295 1099 aa20.17■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 PTMSP20962 102 aa20.17■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 MTX1Q13505 466 aa20.17■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.17■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 SSH3Q8TE77 659 aa20.17■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 FAM89AQ96GI7 184 aa20.17■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 TRAK2O60296 914 aa20.16■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 POLA2Q14181 598 aa20.16■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 ZNF827Q17R98 1081 aa20.16■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 SYNE4Q8N205 404 aa20.16■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.16■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.15■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.15■□□□□ 0.82
BRF1-208ENST00000546997 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
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