RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545097.1

CCR3-208, Transcript of C-C motif chemokine receptor 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR3, Length 1,786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCR3-208	ENST00000545097	NLRP10	Q86W26	655 aa		10.54	□□□□□ -0.72
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	10.54	□□□□□ -0.72
CCR3-208	ENST00000545097	IL16	Q14005	1332 aa		10.53	□□□□□ -0.72
CCR3-208	ENST00000545097	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	10.53	□□□□□ -0.72
CCR3-208	ENST00000545097	RGL2	O15211	777 aa		10.53	□□□□□ -0.72
CCR3-208	ENST00000545097	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	10.53	□□□□□ -0.72
CCR3-208	ENST00000545097	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	10.53	□□□□□ -0.72
CCR3-208	ENST00000545097	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		10.53	□□□□□ -0.72
CCR3-208	ENST00000545097	MYH3	P11055	1940 aa		10.53	□□□□□ -0.72
CCR3-208	ENST00000545097	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.72
CCR3-208	ENST00000545097		H0YIN7	160 aa		10.52	□□□□□ -0.72
CCR3-208	ENST00000545097	C21orf2	O43822	256 aa		10.52	□□□□□ -0.72
CCR3-208	ENST00000545097	ST5	P78524	1137 aa		10.52	□□□□□ -0.72
CCR3-208	ENST00000545097	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.72
CCR3-208	ENST00000545097	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.72
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.72
CCR3-208	ENST00000545097	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		10.52	□□□□□ -0.72
CCR3-208	ENST00000545097	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		10.52	□□□□□ -0.72
CCR3-208	ENST00000545097	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.72
CCR3-208	ENST00000545097	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		10.52	□□□□□ -0.72
CCR3-208	ENST00000545097	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		10.52	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	VAMP4	O75379	141 aa		10.52	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	TCIRG1	Q13488	830 aa		10.52	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	WDR63	Q8IWG1	891 aa		10.52	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	TTLL6	Q8N841	843 aa		10.52	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	PDE6B	P35913	854 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	CRY2	Q49AN0	593 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	LTBP1	Q14766	1721 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	CCER2	I3L3R5	266 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	NPHP1	O15259	732 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	STYK1	Q6J9G0	422 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	HYPK	Q9NX55	129 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	IGKV5-2	P06315	115 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	MASTL	Q96GX5	879 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097		A0A1B0GUL6	1792 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	FAM89A	Q96GI7	184 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	MYD88	Q99836	296 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	NPR1	P16066	1061 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	RNF181	Q9P0P0	153 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	ABCC4	O15439	1325 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	SLC4A2	P04920	1241 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	PARP10	Q53GL7	1025 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	NYX	Q9GZU5	481 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097		F6X3S4	739 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	SLFN5	Q08AF3	891 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CCR3-208	ENST00000545097	GOLGA2	Q08379	1002 aa		10.46	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	FLII	Q13045	1269 aa		10.46	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		10.46	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	CNKSR1	Q969H4	720 aa		10.46	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	KIF3C	O14782	793 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	SCN9A	Q15858	1988 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	KSR2	Q6VAB6	950 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	WDR90	Q96KV7	1748 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	POTEC	B2RU33	542 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	LMNB1	P20700	586 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	CASP7	P55210	303 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	STK31	Q9BXU1	1019 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CCR3-208	ENST00000545097	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		10.43	□□□□□ -0.74

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