RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 CRKLP46109 303 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A087WZG4 1122 aa24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 STAP2Q9UGK3 403 aa24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 TCIRG1Q13488 830 aa24.83■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 HLFQ16534 295 aa24.83■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.83■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.83■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC87Q9NVE4 849 aa24.83■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.83■■□□□ 1.57
PACSIN3-211ENST00000539589 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
PACSIN3-211ENST00000539589 H7C1W4 665 aa24.82■■□□□ 1.56
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNQ4P56696 695 aa24.82■■□□□ 1.56
PACSIN3-211ENST00000539589 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa24.82■■□□□ 1.56
PACSIN3-211ENST00000539589 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PACSIN3-211ENST00000539589 ARXQ96QS3 562 aa24.81■■□□□ 1.56
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.81■■□□□ 1.56
PACSIN3-211ENST00000539589 USP26Q9BXU7 913 aa24.81■■□□□ 1.56
PACSIN3-211ENST00000539589 AOX1Q06278 1338 aa24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-211ENST00000539589 COL15A1P39059 1388 aa24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-211ENST00000539589 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-211ENST00000539589 REC8O95072 547 aa24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-211ENST00000539589 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-211ENST00000539589 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-211ENST00000539589 KIF1BPQ96EK5 621 aa24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-211ENST00000539589 LY75O60449 1722 aa24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-211ENST00000539589 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa24.79■■□□□ 1.56
PACSIN3-211ENST00000539589 RHPN1Q8TCX5 695 aa24.79■■□□□ 1.56
PACSIN3-211ENST00000539589 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.79■■□□□ 1.56
PACSIN3-211ENST00000539589 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-211ENST00000539589 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-211ENST00000539589 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-211ENST00000539589 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-211ENST00000539589 ERC2O15083 957 aa24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-211ENST00000539589 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-211ENST00000539589 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-211ENST00000539589 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-211ENST00000539589 FOXO4P98177 505 aa24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-211ENST00000539589 RABEP1Q15276 862 aa24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-211ENST00000539589 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-211ENST00000539589 GPTP24298 496 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-211ENST00000539589 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-211ENST00000539589 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-211ENST00000539589 KLHDC4Q8TBB5 520 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-211ENST00000539589 KRT27Q7Z3Y8 459 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-211ENST00000539589 NLRP10Q86W26 655 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-211ENST00000539589 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-211ENST00000539589 RILPL2Q969X0 211 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-211ENST00000539589 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-211ENST00000539589 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-211ENST00000539589 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-211ENST00000539589 CAMTA2O94983 1202 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-211ENST00000539589 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-211ENST00000539589 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-211ENST00000539589 BCORQ6W2J9 1755 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-211ENST00000539589 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-211ENST00000539589 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-211ENST00000539589 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 SYNE4Q8N205 404 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 UBN2Q6ZU65 1347 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 CHMLP26374 656 aa24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 SMIM5Q71RC9 77 aa24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF34Q8IZ26 560 aa24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM89AQ96GI7 184 aa24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 SASH1O94885 1247 aa24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM196AQ6ZSG2 479 aa24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 PI4K2BQ8TCG2 481 aa24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 SIL1Q9H173 461 aa24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 COPRSQ9NQ92 184 aa24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 DDIT3P35638 169 aa24.67■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 MYH3P11055 1940 aa24.66■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 TTC41PQ6P2S7 1318 aa24.65■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.65■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.64■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24.64■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM37O94972 964 aa24.64■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 GSE1Q14687 1217 aa24.64■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.64■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 C4BP0C0L5 1744 aa24.64■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.63■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.63■■□□□ 1.53
PACSIN3-211ENST00000539589 ST18O60284 1047 aa24.62■■□□□ 1.53
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