RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532316.1

PKNOX2-AS1-201, Transcript of PKNOX2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PKNOX2-AS1, Length 586 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RTKN2Q8IZC4 609 aa30.82■■■□□ 2.52
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TIAM2Q8IVF5 1701 aa30.81■■■□□ 2.52
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CHMP4AQ9BY43 222 aa30.81■■■□□ 2.52
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RRAGCQ9HB90 399 aa30.81■■■□□ 2.52
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CHPF2Q9P2E5 772 aa30.81■■■□□ 2.52
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CACNA1SQ13698 1873 aa30.8■■■□□ 2.52
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DUSP27Q5VZP5 1158 aa30.8■■■□□ 2.52
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 HYPKQ9NX55 129 aa30.79■■■□□ 2.52
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP30.78■■■□□ 2.52
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa30.78■■■□□ 2.52
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FSTL1Q12841 308 aa30.77■■■□□ 2.52
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TCIRG1Q13488 830 aa30.77■■■□□ 2.52
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GRIPAP1Q4V328 841 aa30.77■■■□□ 2.52
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NLRP3Q96P20 1036 aa30.77■■■□□ 2.52
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa30.76■■■□□ 2.52
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SLC10A5Q5PT55 438 aa30.76■■■□□ 2.51
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PLBD2Q8NHP8 589 aa30.76■■■□□ 2.51
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CRAMP1Q96RY5 1269 aa30.76■■■□□ 2.51
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CCDC184Q52MB2 194 aa30.75■■■□□ 2.51
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CCDC27Q2M243 656 aa30.74■■■□□ 2.51
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa30.74■■■□□ 2.51
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NLRP10Q86W26 655 aa30.74■■■□□ 2.51
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MRS2Q9HD23 443 aa30.74■■■□□ 2.51
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa30.74■■■□□ 2.51
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 APLP1P51693 650 aa30.72■■■□□ 2.51
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PSMD1Q99460 953 aa30.71■■■□□ 2.51
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SMC1BQ8NDV3 1235 aa30.7■■■□□ 2.51
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SH3TC1Q8TE82 1336 aa30.7■■■□□ 2.5
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 WDR90Q96KV7 1748 aa30.69■■■□□ 2.5
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GOLGA2Q08379 1002 aa30.67■■■□□ 2.5
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 OLFM4Q6UX06 510 aa30.67■■■□□ 2.5
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SYNE4Q8N205 404 aa30.67■■■□□ 2.5
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 IARSP41252 1262 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SNED1Q8TER0 1413 aa30.65■■■□□ 2.5
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CCDC30Q5VVM6 783 aa30.65■■■□□ 2.5
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 C3orf67Q6ZVT6 689 aa30.65■■■□□ 2.5
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 WWC1Q8IX03 1113 aa30.65■■■□□ 2.5
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ISCA1Q9BUE6 129 aa30.65■■■□□ 2.5
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 IL16Q14005 1332 aa30.65■■■□□ 2.5
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 C8orf58Q8NAV2 365 aa30.63■■■□□ 2.49
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 IQCA1LA6NCM1 817 aa30.62■■■□□ 2.49
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 BBOX1O75936 387 aa30.62■■■□□ 2.49
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DDNO94850 711 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RIC3Q7Z5B4 369 aa30.62■■■□□ 2.49
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 JDP2Q8WYK2 163 aa30.62■■■□□ 2.49
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CEP350Q5VT06 3117 aa30.62■■■□□ 2.49
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 POTECB2RU33 542 aa30.61■■■□□ 2.49
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa30.61■■■□□ 2.49
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ABCC4O15439 1325 aa30.61■■■□□ 2.49
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DDX58O95786 925 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa30.58■■■□□ 2.49
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FZD9O00144 591 aa30.58■■■□□ 2.49
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TMC4Q7Z404 712 aa30.58■■■□□ 2.49
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 VPS33BQ9H267 617 aa30.58■■■□□ 2.49
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 STK31Q9BXU1 1019 aa30.57■■■□□ 2.48
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GRAPQ13588 217 aa30.56■■■□□ 2.48
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SUPT20HQ8NEM7 779 aa30.56■■■□□ 2.48
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SP8Q8IXZ3 490 aa30.55■■■□□ 2.48
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FAM89AQ96GI7 184 aa30.55■■■□□ 2.48
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ZNF541Q9H0D2 1346 aa30.54■■■□□ 2.48
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 EIF6P56537 245 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 WDR63Q8IWG1 891 aa30.54■■■□□ 2.48
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 LARGE2Q8N3Y3 721 aa30.54■■■□□ 2.48
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TSPYL6Q8N831 410 aa30.54■■■□□ 2.48
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GPC2Q8N158 579 aa30.53■■■□□ 2.48
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CCDC191Q8NCU4 936 aa30.53■■■□□ 2.48
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 LAMB2P55268 1798 aa30.53■■■□□ 2.48
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SCN4AP35499 1836 aa30.52■■■□□ 2.48
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MYD88Q99836 296 aa30.51■■■□□ 2.47
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CHADLQ6NUI6 762 aa30.5■■■□□ 2.47
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NIM1KQ8IY84 436 aa30.5■■■□□ 2.47
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 HACL1Q9UJ83 578 aa30.5■■■□□ 2.47
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