RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527785.1

TMEM25-216, Transcript of transmembrane protein 25, human

TSL 3

Gene TMEM25, Length 841 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM25-216	ENST00000527785	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
TMEM25-216	ENST00000527785	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		33.29	■■■□□ 2.92
TMEM25-216	ENST00000527785	FAM177B	A6PVY3	158 aa		33.29	■■■□□ 2.92
TMEM25-216	ENST00000527785	GPT	P24298	496 aa		33.29	■■■□□ 2.92
TMEM25-216	ENST00000527785	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		33.29	■■■□□ 2.92
TMEM25-216	ENST00000527785	NUP98	P52948	1817 aa		33.29	■■■□□ 2.92
TMEM25-216	ENST00000527785	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		33.28	■■■□□ 2.92
TMEM25-216	ENST00000527785	TCIRG1	Q13488	830 aa		33.28	■■■□□ 2.92
TMEM25-216	ENST00000527785	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
TMEM25-216	ENST00000527785	SUSD4	Q5VX71	490 aa		33.26	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	STK31	Q9BXU1	1019 aa		33.26	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		33.26	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		33.26	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	GLTPD2	A6NH11	291 aa		33.25	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	PRELP	P51888	382 aa		33.25	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	MIER1	Q8N108	512 aa		33.25	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	NTSR2	O95665	410 aa		33.24	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	ALDH1B1	P30837	517 aa		33.24	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	RRAGC	Q9HB90	399 aa		33.24	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		33.24	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		33.23	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		33.22	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	ERFE	Q4G0M1	354 aa		33.22	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	SLX4	Q8IY92	1834 aa		33.22	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		33.22	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	CCDC93	Q567U6	631 aa		33.21	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	NLRP10	Q86W26	655 aa		33.21	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		33.21	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	VAMP4	O75379	141 aa		33.2	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	FSTL1	Q12841	308 aa		33.2	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		33.2	■■■□□ 2.91
TMEM25-216	ENST00000527785	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
TMEM25-216	ENST00000527785	APLP1	P51693	650 aa		33.19	■■■□□ 2.9
TMEM25-216	ENST00000527785	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		33.19	■■■□□ 2.9
TMEM25-216	ENST00000527785		E9PSI1	815 aa		33.18	■■■□□ 2.9
TMEM25-216	ENST00000527785	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
TMEM25-216	ENST00000527785	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		33.18	■■■□□ 2.9
TMEM25-216	ENST00000527785	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		33.18	■■■□□ 2.9
TMEM25-216	ENST00000527785	ABCC12	Q96J65	1359 aa		33.18	■■■□□ 2.9
TMEM25-216	ENST00000527785	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		33.18	■■■□□ 2.9
TMEM25-216	ENST00000527785	CRY2	Q49AN0	593 aa		33.17	■■■□□ 2.9
TMEM25-216	ENST00000527785	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		33.17	■■■□□ 2.9
TMEM25-216	ENST00000527785	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		33.17	■■■□□ 2.9
TMEM25-216	ENST00000527785	SLC4A2	P04920	1241 aa		33.16	■■■□□ 2.9
TMEM25-216	ENST00000527785	CACNA1S	Q13698	1873 aa		33.16	■■■□□ 2.9
TMEM25-216	ENST00000527785	CEP350	Q5VT06	3117 aa		33.15	■■■□□ 2.9
TMEM25-216	ENST00000527785	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
TMEM25-216	ENST00000527785	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
TMEM25-216	ENST00000527785	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
TMEM25-216	ENST00000527785	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		33.12	■■■□□ 2.89
TMEM25-216	ENST00000527785	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		33.12	■■■□□ 2.89
TMEM25-216	ENST00000527785	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	33.12	■■■□□ 2.89
TMEM25-216	ENST00000527785	KSR2	Q6VAB6	950 aa		33.12	■■■□□ 2.89
TMEM25-216	ENST00000527785	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		33.12	■■■□□ 2.89
TMEM25-216	ENST00000527785	NLRP3	Q96P20	1036 aa		33.12	■■■□□ 2.89
TMEM25-216	ENST00000527785	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
TMEM25-216	ENST00000527785	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		33.1	■■■□□ 2.89
TMEM25-216	ENST00000527785	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
TMEM25-216	ENST00000527785	SLFN5	Q08AF3	891 aa		33.1	■■■□□ 2.89
TMEM25-216	ENST00000527785	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		33.1	■■■□□ 2.89
TMEM25-216	ENST00000527785	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
TMEM25-216	ENST00000527785	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
TMEM25-216	ENST00000527785	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TMEM25-216	ENST00000527785	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		33.08	■■■□□ 2.89
TMEM25-216	ENST00000527785	FLII	Q13045	1269 aa		33.08	■■■□□ 2.89
TMEM25-216	ENST00000527785	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		33.08	■■■□□ 2.89
TMEM25-216	ENST00000527785	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		33.08	■■■□□ 2.89
TMEM25-216	ENST00000527785	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		33.08	■■■□□ 2.89
TMEM25-216	ENST00000527785	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		33.07	■■■□□ 2.88
TMEM25-216	ENST00000527785	MYD88	Q99836	296 aa		33.07	■■■□□ 2.88
TMEM25-216	ENST00000527785	G2E3	Q7L622	706 aa		33.06	■■■□□ 2.88
TMEM25-216	ENST00000527785	WDR90	Q96KV7	1748 aa		33.05	■■■□□ 2.88
TMEM25-216	ENST00000527785	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
TMEM25-216	ENST00000527785	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TMEM25-216	ENST00000527785	PSMD1	Q99460	953 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TMEM25-216	ENST00000527785	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
TMEM25-216	ENST00000527785	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
TMEM25-216	ENST00000527785	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
TMEM25-216	ENST00000527785	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
TMEM25-216	ENST00000527785	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
TMEM25-216	ENST00000527785	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
TMEM25-216	ENST00000527785	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		33.02	■■■□□ 2.88
TMEM25-216	ENST00000527785	SYNE4	Q8N205	404 aa		33.02	■■■□□ 2.88
TMEM25-216	ENST00000527785	ZNF428	Q96B54	188 aa		33.02	■■■□□ 2.88
TMEM25-216	ENST00000527785	FAM89A	Q96GI7	184 aa		33.02	■■■□□ 2.88
TMEM25-216	ENST00000527785	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
TMEM25-216	ENST00000527785	OLFM4	Q6UX06	510 aa		33.01	■■■□□ 2.87
TMEM25-216	ENST00000527785	POTEC	B2RU33	542 aa		33	■■■□□ 2.87
TMEM25-216	ENST00000527785	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
TMEM25-216	ENST00000527785	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		33	■■■□□ 2.87
TMEM25-216	ENST00000527785	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		32.99	■■■□□ 2.87
TMEM25-216	ENST00000527785	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
TMEM25-216	ENST00000527785	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
TMEM25-216	ENST00000527785	CACNA1F	O60840	1977 aa		32.99	■■■□□ 2.87

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