RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 SLC51AQ86UW1 340 aa18.49■□□□□ 0.55
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PTPRU-209ENST00000526080 KDM3BQ7LBC6 1761 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRU-209ENST00000526080 EPS15P42566 896 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRU-209ENST00000526080 RGS19P49795 217 aa18.48■□□□□ 0.55
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PTPRU-209ENST00000526080 DCTN1Q14203 1278 aa18.46■□□□□ 0.55
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PTPRU-209ENST00000526080 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
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PTPRU-209ENST00000526080 MAP2K2P36507 400 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRU-209ENST00000526080 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRU-209ENST00000526080 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRU-209ENST00000526080 TTLL7Q6ZT98 887 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRU-209ENST00000526080 C3orf67Q6ZVT6 689 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRU-209ENST00000526080 AOC2O75106 756 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRU-209ENST00000526080 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
PTPRU-209ENST00000526080 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP18.41■□□□□ 0.54
PTPRU-209ENST00000526080 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
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PTPRU-209ENST00000526080 NIM1KQ8IY84 436 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF34Q8IZ26 560 aa18.4■□□□□ 0.54
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PTPRU-209ENST00000526080 PGAP2Q9UHJ9 254 aa18.4■□□□□ 0.54
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PTPRU-209ENST00000526080 AOC3Q16853 763 aa18.38■□□□□ 0.53
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PTPRU-209ENST00000526080 CDHR2Q9BYE9 1310 aa18.37■□□□□ 0.53
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PTPRU-209ENST00000526080 LRP10Q7Z4F1 713 aa18.36■□□□□ 0.53
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PTPRU-209ENST00000526080 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
PTPRU-209ENST00000526080 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
PTPRU-209ENST00000526080 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa18.35■□□□□ 0.53
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PTPRU-209ENST00000526080 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRU-209ENST00000526080 SLC10A5Q5PT55 438 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRU-209ENST00000526080 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRU-209ENST00000526080 LRRC37AA6NMS7 1700 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRU-209ENST00000526080 PARP10Q53GL7 1025 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRU-209ENST00000526080 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRU-209ENST00000526080 KIAA2012Q0VF49 1180 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRU-209ENST00000526080 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRU-209ENST00000526080 SUPT20HQ8NEM7 779 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRU-209ENST00000526080 TRPM4Q8TD43 1214 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRU-209ENST00000526080 NLRP3Q96P20 1036 aa18.32■□□□□ 0.52
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