RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.38□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 CEP63Q96MT8 703 aa7.38□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 BRD7Q9NPI1 651 aa7.38□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 MARK1Q9P0L2 795 aa7.38□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 PHF24Q9UPV7 400 aa7.38□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 GJA3Q9Y6H8 435 aa7.38□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 IDH3AP50213 366 aa7.37□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 MTMR3Q13615 1198 aa7.37□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.37□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 USP20Q9Y2K6 914 aa7.37□□□□□ -1.23
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CLVS1-209ENST00000522928 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.36□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 FCHSD1Q86WN1 690 aa7.36□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 TREML1Q86YW5 311 aa7.36□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM151AQ8N4L1 468 aa7.36□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.36□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.36□□□□□ -1.23
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CLVS1-209ENST00000522928 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 HELQQ8TDG4 1101 aa7.35□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 GSX2Q9BZM3 304 aa7.35□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 STIM2Q9P246 746 aa7.35□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 KCNMB2Q9Y691 235 aa7.35□□□□□ -1.23
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CLVS1-209ENST00000522928 ARAFP10398 606 aa7.34□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 MAP2K3P46734 347 aa7.34□□□□□ -1.23
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CLVS1-209ENST00000522928 GGA1Q9UJY5 639 aa7.34□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 OIP5O43482 229 aa7.33□□□□□ -1.24
CLVS1-209ENST00000522928 GDF11O95390 407 aa7.33□□□□□ -1.24
CLVS1-209ENST00000522928 BRD2P25440 801 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CLVS1-209ENST00000522928 SERPINB4P48594 390 aa7.33□□□□□ -1.24
CLVS1-209ENST00000522928 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CLVS1-209ENST00000522928 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CLVS1-209ENST00000522928 HIF1AQ16665 826 aa7.33□□□□□ -1.24
CLVS1-209ENST00000522928 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CLVS1-209ENST00000522928 ATCAYQ86WG3 371 aa7.33□□□□□ -1.24
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CLVS1-209ENST00000522928 BCRP11274 1271 aa7.32□□□□□ -1.24
CLVS1-209ENST00000522928 RASSF7Q02833 373 aa7.32□□□□□ -1.24
CLVS1-209ENST00000522928 ANO2Q9NQ90 1003 aa7.32□□□□□ -1.24
CLVS1-209ENST00000522928 NEURL1BA8MQ27 555 aa7.31□□□□□ -1.24
CLVS1-209ENST00000522928 EGFRP00533 1210 aa7.31□□□□□ -1.24
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CLVS1-209ENST00000522928 ARSDP51689 593 aa7.31□□□□□ -1.24
CLVS1-209ENST00000522928 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa7.31□□□□□ -1.24
CLVS1-209ENST00000522928 SYT9Q86SS6 491 aa7.31□□□□□ -1.24
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CLVS1-209ENST00000522928 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-209ENST00000522928 RGL4Q8IZJ4 473 aa7.3□□□□□ -1.24
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CLVS1-209ENST00000522928 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-209ENST00000522928 C11orf16Q9NQ32 467 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-209ENST00000522928 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-209ENST00000522928 ADAMTS8Q9UP79 889 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-209ENST00000522928 STARD13Q9Y3M8 1113 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-209ENST00000522928 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.28□□□□□ -1.24
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CLVS1-209ENST00000522928 SASH3O75995 380 aa7.28□□□□□ -1.24
CLVS1-209ENST00000522928 BRD1O95696 1058 aa7.28□□□□□ -1.24
CLVS1-209ENST00000522928 CCINQ13939 588 aa7.28□□□□□ -1.24
CLVS1-209ENST00000522928 SVOPQ8N4V2 548 aa7.28□□□□□ -1.24
CLVS1-209ENST00000522928 GALNT6Q8NCL4 622 aa7.28□□□□□ -1.24
CLVS1-209ENST00000522928 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.28□□□□□ -1.24
CLVS1-209ENST00000522928 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.28□□□□□ -1.24
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CLVS1-209ENST00000522928 PRR12Q9ULL5 1215 aa7.28□□□□□ -1.24
CLVS1-209ENST00000522928 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
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CLVS1-209ENST00000522928 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
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CLVS1-209ENST00000522928 TNFRSF25Q93038 417 aa7.27□□□□□ -1.25
CLVS1-209ENST00000522928 BHMTQ93088 406 aa7.27□□□□□ -1.25
CLVS1-209ENST00000522928 BTBD6Q96KE9 485 aa7.27□□□□□ -1.25
CLVS1-209ENST00000522928 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7.27□□□□□ -1.25
CLVS1-209ENST00000522928 XYLBO75191 536 aa7.26□□□□□ -1.25
CLVS1-209ENST00000522928 MAP3K6O95382 1288 aa7.26□□□□□ -1.25
CLVS1-209ENST00000522928 ABL1P00519 1130 aa7.26□□□□□ -1.25
CLVS1-209ENST00000522928 NFKB1P19838 968 aa7.26□□□□□ -1.25
CLVS1-209ENST00000522928 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CLVS1-209ENST00000522928 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CLVS1-209ENST00000522928 CCDC87Q9NVE4 849 aa7.26□□□□□ -1.25
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