RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521962.1

HACE1-211, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 4

Gene HACE1, Length 561 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-211ENST00000521962 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.18■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.18■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.18■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.18■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 ST5P78524 1137 aa21.17■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 NMRK2Q9NPI5 230 aa21.17■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.16■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 ERFEQ4G0M1 354 aa21.16■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.16■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.16■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 ZNF428Q96B54 188 aa21.16■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 PI4KAP2A4QPH2 592 aa21.15■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 NPHP1O15259 732 aa21.15■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 KSR2Q6VAB6 950 aa21.15■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa21.15■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.15■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa21.15■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 NYXQ9GZU5 481 aa21.15■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.15■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 MYD88Q99836 296 aa21.14■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 SBF1O95248 1867 aa21.13■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 PDE6BP35913 854 aa21.13■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.13■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.13■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 SYNE4Q8N205 404 aa21.13■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.13■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 CACNA1FO60840 1977 aa21.12■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.12■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 IGKV5-2P06315 115 aa21.12■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 C9orf131Q5VYM1 1079 aa21.12■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 SRGNP10124 158 aa21.11■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.11■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 PIM2Q9P1W9 311 aa21.11■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 H0YIN7 160 aa21.1■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 CRY2Q49AN0 593 aa21.1■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 F6X3S4 739 aa21.09■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 LAMB2P55268 1798 aa21.09■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.08■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.08■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.08■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 DNAAF4Q8WXU2 420 aa21.08■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.08■□□□□ 0.97
HACE1-211ENST00000521962 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 STYK1Q6J9G0 422 aa21.07■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.07■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 FAM89AQ96GI7 184 aa21.07■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.06■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.06■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 MASTLQ96GX5 879 aa21.06■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 NPR1P16066 1061 aa21.05■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 FSTL1Q12841 308 aa21.05■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 TTLL6Q8N841 843 aa21.05■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.05■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 BEND3Q5T5X7 828 aa21.04■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 JMYQ8N9B5 988 aa21.04■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 SLX4Q8IY92 1834 aa21.04■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 COL4A1P02462 1669 aa21.03■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.03■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 LINS1Q8NG48 757 aa21.03■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 RNF181Q9P0P0 153 aa21.03■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 CACNA1SQ13698 1873 aa21.03■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 PTPRCP08575 1304 aa21.03■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.03■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 SLC51AQ86UW1 340 aa21.02■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 KLRG1Q96E93 195 aa21.02■□□□□ 0.96
HACE1-211ENST00000521962 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 HTRA3P83110 453 aa21.01■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 GCKRQ14397 625 aa21.01■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 CNKSR1Q969H4 720 aa21.01■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 NLRP3Q96P20 1036 aa21.01■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.01■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 C7orf43Q8WVR3 580 aa21■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 SNED1Q8TER0 1413 aa21■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 TIAM2Q8IVF5 1701 aa21■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 CASP7P55210 303 aa20.99■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms