RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516206.1

RNU6-904P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 904, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-904P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-904P-201ENST00000516206 RNF43Q68DV7 783 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 Q6ZS46 218 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 TMEM130Q8N3G9 435 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 SHKBP1Q8TBC3 707 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF592Q92610 1267 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 CEP63Q96MT8 703 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 DBNDD2Q9BQY9 259 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 BRD7Q9NPI1 651 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 KCNH4Q9UQ05 1017 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 CDK2AP1O14519 115 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 CPB1P15086 417 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 PLAURQ03405 335 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 USP4Q13107 963 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 GRIK5Q16478 980 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 TSGA10IPQ3SY00 556 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 FAM35AQ86V20 835 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 TP53INP2Q8IXH6 220 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 ARMC10Q8N2F6 343 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 DOLKQ9UPQ8 538 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 A6NJY4 79 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 COL19A1Q14993 1142 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 OXLD1Q5BKU9 147 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 KSR1Q8IVT5 923 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 CEP126Q9P2H0 1117 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 SFI1A8K8P3 1242 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 WDR64B1ANS9 1081 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 PAPLNO95428 1278 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 KCNQ4P56696 695 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 NFXL1Q6ZNB6 911 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 FBXL18Q96ME1 805 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 LPIN3Q9BQK8 851 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 CCDC39Q9UFE4 941 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 EML1O00423 815 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 KRTAP1-1Q07627 177 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 PDE4DQ08499 809 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 MTFR1Q15390 333 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 TMEM132AQ24JP5 1023 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 PERM1Q5SV97 790 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 RHPN1Q8TCX5 695 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 L3MBTL2Q969R5 705 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 HSH2DQ96JZ2 352 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 AK7Q96M32 723 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF232Q9UNY5 417 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 TYRO3Q06418 890 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 VSIG10LQ86VR7 867 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 C7orf43Q8WVR3 580 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 PNMA5Q96PV4 448 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 SLC4A9Q96Q91 983 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 CSRNP1Q96S65 589 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 SLC38A3Q99624 504 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 FRRS1LQ9P0K9 344 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 PIM2Q9P1W9 311 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 TMEM229AB2RXF0 380 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 NFKB1P19838 968 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 MSMPQ1L6U9 139 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 LCNL1Q6ZST4 164 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 SIRT1Q96EB6 747 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 CEP41Q9BYV8 373 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 LMCD1Q9NZU5 365 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 PSPNO60542 156 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 PRNPP04156 253 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 NOS2P35228 1153 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 SH3D19Q5HYK7 790 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF280CQ8ND82 737 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 FLCNQ8NFG4 579 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 MYRFLQ96LU7 910 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 MFSD14AQ96MC6 490 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 KCNF1Q9H3M0 494 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 LEMD3Q9Y2U8 911 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-904P-201ENST00000516206 WISP1O95388 367 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-904P-201ENST00000516206 CFPP27918 469 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-904P-201ENST00000516206 GRNP28799 593 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-904P-201ENST00000516206 RFC5P40937 340 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-904P-201ENST00000516206 TEAD4Q15561 434 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-904P-201ENST00000516206 PCSK7Q16549 785 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-904P-201ENST00000516206 UVSSAQ2YD98 709 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-904P-201ENST00000516206 TBCELQ5QJ74 424 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-904P-201ENST00000516206 BEND4Q6ZU67 534 aa3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms