RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	CEP162	Q5TB80	1403 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	SOBP	A7XYQ1	873 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	PDE4C	Q08493	712 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	POU4F2	Q12837	409 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	USP3	Q9Y6I4	520 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	A2M	P01023	1474 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	C4orf17	Q53FE4	359 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF787	Q6DD87	383 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	RETREG2	Q8NC44	543 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	NCOA1	Q15788	1441 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	RHOQ	P17081	205 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	IGFBP4	P22692	258 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	WEE1	P30291	646 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	TEAD4	Q15561	434 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	MBD5	Q9P267	1494 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	C21orf2	O43822	256 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	CABP1	Q9NZU7	370 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	PLA2R1	Q13018	1463 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PDE4D-222	ENST00000514552	PTS	Q03393	145 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	POTEA	Q6S8J7	498 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	ZMYM3	Q14202	1370 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	SERTM1	A2A2V5	107 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	LGR5	O75473	907 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	NOS2	P35228	1153 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	PHKA2	P46019	1235 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	PLA2G4A	P47712	749 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	10.75	□□□□□ -0.69	1e-6	■■■■□ 19.9
PDE4D-222	ENST00000514552	OCLN	Q16625	522 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	PTPRK	Q15262	1439 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552		A0A1B0GTH6	734 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC35F4	A4IF30	521 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	FOXO3	O43524	673 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	PRMT3	O60678	531 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	NCOA2	Q15596	1464 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	EML1	O00423	815 aa		10.73	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	SLAIN2	Q9P270	581 aa		10.73	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		10.73	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		10.73	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	ATP2B4	P23634	1241 aa		10.72	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		10.72	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		10.72	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		10.72	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		10.72	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	CARNS1	A5YM72	827 aa		10.71	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		10.71	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	MAP3K1	Q13233	1512 aa		10.71	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		10.71	□□□□□ -0.69
PDE4D-222	ENST00000514552	PZP	P20742	1482 aa		10.7	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		10.7	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	F11	P03951	625 aa		10.7	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		10.7	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	AIDA	Q96BJ3	306 aa		10.7	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		10.69	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	SSFA2	P28290	1259 aa		10.69	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	MSX1	P28360	303 aa		10.69	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7

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