RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514415.1

HOXC10-204, Transcript of homeobox C10, humanhuman

TSL 3

Gene HOXC10, Length 550 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10-204ENST00000514415 GPT2Q8TD30 523 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC10-204ENST00000514415 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
HOXC10-204ENST00000514415 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC10-204ENST00000514415 LAMA4Q16363 1823 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC10-204ENST00000514415 MYH15Q9Y2K3 1946 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC10-204ENST00000514415 ESPNB1AK53 854 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC10-204ENST00000514415 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
HOXC10-204ENST00000514415 ANKRD1Q15327 319 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC10-204ENST00000514415 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
HOXC10-204ENST00000514415 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC10-204ENST00000514415 MAP4K1Q92918 833 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC10-204ENST00000514415 IL25Q9H293 177 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC10-204ENST00000514415 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC10-204ENST00000514415 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXC10-204ENST00000514415 MED23Q9ULK4 1368 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC10-204ENST00000514415 AK2P54819 239 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC10-204ENST00000514415 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC10-204ENST00000514415 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC10-204ENST00000514415 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXC10-204ENST00000514415 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 ATP5JP18859 108 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 RUFY3Q7L099 469 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 COPS6Q7L5N1 327 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 PDLIM2Q96JY6 352 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 GPR108Q9NPR9 543 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 MYH7P12883 1935 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 ERVV-2B6SEH9 535 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 KRT32Q14532 448 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 UVSSAQ2YD98 709 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 RASEFQ8IZ41 740 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 FAM184AQ8NB25 1140 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 MYD88Q99836 296 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 STX6O43752 255 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 CASTP20810 708 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 CABP4P57796 275 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 TMEM63CQ9P1W3 806 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 KCPQ6ZWJ8 1503 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 NHSL1Q5SYE7 1610 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 CYP27B1O15528 508 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 PDCP20941 246 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 MCM5P33992 734 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 PTH1RQ03431 593 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 USPL1Q5W0Q7 1092 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 CREB3L3Q68CJ9 461 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 ARXQ96QS3 562 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 ATG3Q9NT62 314 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 MYH3P11055 1940 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 WDR17Q8IZU2 1322 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 F13A1P00488 732 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 CASP7P55210 303 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 UBE2HP62256 183 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 SLC39A6Q13433 755 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 ZSCAN30Q86W11 494 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 FBXO3Q9UK99 471 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 TNS2Q63HR2 1409 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 ITGB4P16144 1822 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 H7C1W4 665 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 SLC27A2O14975 620 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 SYT1P21579 422 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 TNNI3KQ59H18 835 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 FSD1Q9BTV5 496 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 RBSNQ9H1K0 784 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 TSPY26PQ9H489 355 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 USP16Q9Y5T5 823 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 PALLDQ8WX93 1383 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 MYL6BP14649 208 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 KCNJ4P48050 445 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 CCDC183Q5T5S1 534 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXC10-204ENST00000514415 STRCQ7RTU9 1775 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC10-204ENST00000514415 LRP6O75581 1613 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC10-204ENST00000514415 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXC10-204ENST00000514415 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC10-204ENST00000514415 USP48Q86UV5 1035 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms