RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512247.5

LNX1-208, Transcript of ligand of numb-protein X 1, human

TSL 3

Gene LNX1, Length 603 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LNX1-208	ENST00000512247	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LNX1-208	ENST00000512247	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LNX1-208	ENST00000512247	NOG	Q13253	232 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LNX1-208	ENST00000512247	NIM1K	Q8IY84	436 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LNX1-208	ENST00000512247	PSMD1	Q99460	953 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LNX1-208	ENST00000512247	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
LNX1-208	ENST00000512247	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	MRC1	P22897	1456 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	HUNK	P57058	714 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	CFAP53	Q96M91	514 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	ZIC5	Q96T25	663 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	LTBP1	Q14766	1721 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	PPIP5K2	O43314	1243 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	TRPA1	O75762	1119 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	NBPF15	Q8N660	670 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	CACNA1S	Q13698	1873 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	USP16	Q9Y5T5	823 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	SCN7A	Q01118	1682 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	BTBD11	A6QL63	1104 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	AOC3	Q16853	763 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	USP48	Q86UV5	1035 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	GCC1	Q96CN9	775 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	MRS2	Q9HD23	443 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	KCNQ3	O43525	872 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	NYX	Q9GZU5	481 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LNX1-208	ENST00000512247	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	PPP2R1A	P30153	589 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	CXCL9	Q07325	125 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	RGMB	Q6NW40	437 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	NGEF	Q8N5V2	710 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	CCDC102A	Q96A19	550 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	RNF186	Q9NXI6	227 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	NUDC	Q9Y266	331 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	RAD17	O75943	681 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	HLF	Q16534	295 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	DLK2	Q6UY11	383 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	COL4A5	P29400	1685 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247		H7C1D1	291 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	TNIP1	Q15025	636 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	11.25	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	CRY2	Q49AN0	593 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	SLC51A	Q86UW1	340 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	ABCC12	Q96J65	1359 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	GPT	P24298	496 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	SHTN1	A0MZ66	631 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	NBPF26	B4DH59	902 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	MICALL2	Q8IY33	904 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	SNED1	Q8TER0	1413 aa		11.22	□□□□□ -0.61

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