RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLX4Q8IY92 1834 aa19.67■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC10A5Q5PT55 438 aa19.66■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHPF2Q9P2E5 772 aa19.66■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ABCC12Q96J65 1359 aa19.66■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANP32CO43423 234 aa19.65■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TCIRG1Q13488 830 aa19.65■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa19.65■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NLRP3Q96P20 1036 aa19.65■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHMP4AQ9BY43 222 aa19.65■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HYPKQ9NX55 129 aa19.65■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP19.64■□□□□ 0.73
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FSTL1Q12841 308 aa19.64■□□□□ 0.73
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GRIPAP1Q4V328 841 aa19.64■□□□□ 0.73
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC184Q52MB2 194 aa19.64■□□□□ 0.73
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLBD2Q8NHP8 589 aa19.64■□□□□ 0.73
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CRAMP1Q96RY5 1269 aa19.64■□□□□ 0.73
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa19.63■□□□□ 0.73
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa19.63■□□□□ 0.73
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NLRP10Q86W26 655 aa19.63■□□□□ 0.73
HOXC-AS3-201ENST00000509870 APLP1P51693 650 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC27Q2M243 656 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MRS2Q9HD23 443 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SMC1BQ8NDV3 1235 aa19.6■□□□□ 0.73
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PSMD1Q99460 953 aa19.6■□□□□ 0.73
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SH3TC1Q8TE82 1336 aa19.59■□□□□ 0.73
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OLFM4Q6UX06 510 aa19.59■□□□□ 0.73
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SYNE4Q8N205 404 aa19.59■□□□□ 0.73
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa19.58■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 POTECB2RU33 542 aa19.57■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IARSP41252 1262 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C3orf67Q6ZVT6 689 aa19.57■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C8orf58Q8NAV2 365 aa19.57■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TIAM2Q8IVF5 1701 aa19.56■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BBOX1O75936 387 aa19.56■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DDNO94850 711 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GOLGA2Q08379 1002 aa19.56■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC30Q5VVM6 783 aa19.56■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WWC1Q8IX03 1113 aa19.56■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ISCA1Q9BUE6 129 aa19.56■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CACNA1SQ13698 1873 aa19.56■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RIC3Q7Z5B4 369 aa19.55■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 JDP2Q8WYK2 163 aa19.55■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IL16Q14005 1332 aa19.54■□□□□ 0.72
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CEP350Q5VT06 3117 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SNED1Q8TER0 1413 aa19.53■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa19.53■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FZD9O00144 591 aa19.53■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VPS33BQ9H267 617 aa19.53■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WDR90Q96KV7 1748 aa19.53■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DDX58O95786 925 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ABCC4O15439 1325 aa19.51■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMC4Q7Z404 712 aa19.51■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SP8Q8IXZ3 490 aa19.51■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM89AQ96GI7 184 aa19.51■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GRAPQ13588 217 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LARGE2Q8N3Y3 721 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TSPYL6Q8N831 410 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SUPT20HQ8NEM7 779 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STK31Q9BXU1 1019 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EIF6P56537 245 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WDR63Q8IWG1 891 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPC2Q8N158 579 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF541Q9H0D2 1346 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHADLQ6NUI6 762 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC191Q8NCU4 936 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MPNDQ8N594 471 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MYD88Q99836 296 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HACL1Q9UJ83 578 aa19.47■□□□□ 0.71
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