RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, human

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HERC3-209	ENST00000504994	TNFRSF21	O75509	655 aa		7.31	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	USP17L7	P0C7H9	530 aa		7.31	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	PTGIR	P43119	386 aa		7.31	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	KCNC4	Q03721	635 aa		7.31	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	PAK2	Q13177	524 aa		7.31	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	SDE2	Q6IQ49	451 aa		7.31	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		7.31	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		7.31	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		7.31	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		7.31	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		7.3	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	GGCX	P38435	758 aa		7.3	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	NNT	Q13423	1086 aa		7.3	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994		Q6ZVU0	165 aa		7.3	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		7.3	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	TTC16	Q8NEE8	873 aa		7.3	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		7.3	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	NLRP3	Q96P20	1036 aa		7.3	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	7.3	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		7.3	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		7.3	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	USP20	Q9Y2K6	914 aa		7.3	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	WNT7A	O00755	349 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	GIPC1	O14908	333 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	PLA2G4A	P47712	749 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	VPS37D	Q86XT2	251 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	NPHS2	Q9NP85	383 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	COPRS	Q9NQ92	184 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	7.29	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	IDH3A	P50213	366 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	RELB	Q01201	579 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	GPRASP2	Q96D09	838 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	ITPKC	Q96DU7	683 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HERC3-209	ENST00000504994	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	C4orf17	Q53FE4	359 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	SOGA3	Q5TF21	947 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	SUSD3	Q96L08	255 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	IER5	Q5VY09	327 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	XKR5	Q6UX68	686 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	BCO2	Q9BYV7	579 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	PHACTR2	O75167	634 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	ALDH1A1	P00352	501 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	TCEAL1	Q15170	157 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	CHRD	Q9H2X0	955 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	INPP5B	P32019	993 aa		7.24	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	ARSD	P51689	593 aa		7.24	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	HIF1A	Q16665	826 aa		7.24	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		7.24	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	GPATCH3	Q96I76	525 aa		7.24	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	SPACA7	Q96KW9	195 aa		7.24	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		7.24	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		7.24	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	ELP3	Q9H9T3	547 aa		7.24	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		7.24	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	POTEC	B2RU33	542 aa		7.23	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		7.23	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994		F6X3S4	739 aa		7.23	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	SERINC3	Q13530	473 aa		7.23	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	GRM2	Q14416	872 aa		7.23	□□□□□ -1.25
HERC3-209	ENST00000504994	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		7.23	□□□□□ -1.25

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