RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 UBN2Q6ZU65 1347 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A0G2JLW4 131 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 NTSR2O95665 410 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 DPEP1P16444 411 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 STYK1Q6J9G0 422 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 LINS1Q8NG48 757 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 MASTLQ96GX5 879 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 KIF13BQ9NQT8 1826 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 KIF16BQ96L93 1317 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 NPR1P16066 1061 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 ALDH1B1P30837 517 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 G2E3Q7L622 706 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 SSH1Q8WYL5 1049 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 PXDNLA1KZ92 1463 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 ERFEQ4G0M1 354 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 SOGA3Q5TF21 947 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 TTLL6Q8N841 843 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 ARHGAP45Q92619 1136 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 ADCY9O60503 1353 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 SRGNP10124 158 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 RARSP54136 660 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP18.45■□□□□ 0.544e-7■■□□□ 11.4
SH3BP2-208ENST00000504294 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 ALDH1L1O75891 902 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 NUTM1Q86Y26 1132 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 HDAC5Q9UQL6 1122 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 NEURL1BA8MQ27 555 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 CRY2Q49AN0 593 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 GRIPAP1Q4V328 841 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 BCS1LQ9Y276 419 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 KCNA3P22001 575 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 CHRNA5P30532 468 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 CDHR2Q9BYE9 1310 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 GCKRQ14397 625 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC4A10Q6U841 1118 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM89AQ96GI7 184 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 CRAMP1Q96RY5 1269 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 PDE8AO60658 829 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 IGKV5-2P06315 115 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 CCT4P50991 539 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 BEND3Q5T5X7 828 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 TMC4Q7Z404 712 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC24Q8N4L8 307 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 BCL2L13Q9BXK5 485 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 MS4A1P11836 297 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 F6X3S4 739 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 H7C1W4 665 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 BBOX1O75936 387 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC152Q4G0S7 254 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 ABCC12Q96J65 1359 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 GRM8O00222 908 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 RTKN2Q8IZC4 609 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 PLA2G12BQ9BX93 195 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC93Q567U6 631 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 GRAPQ13588 217 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 DLEC1Q9Y238 1755 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 BCAR3O75815 825 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 CTSWP56202 376 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 RCAN3Q9UKA8 241 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 C21orf2O43822 256 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.5 ms