RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502974.1

CXCL3-202, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 2

Gene CXCL3, Length 630 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-202ENST00000502974 SLX4Q8IY92 1834 aa32.15■■■□□ 2.74
CXCL3-202ENST00000502974 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
CXCL3-202ENST00000502974 RASSF7Q02833 373 aa32.15■■■□□ 2.74
CXCL3-202ENST00000502974 ERFEQ4G0M1 354 aa32.15■■■□□ 2.74
CXCL3-202ENST00000502974 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
CXCL3-202ENST00000502974 STK31Q9BXU1 1019 aa32.15■■■□□ 2.74
CXCL3-202ENST00000502974 RNF181Q9P0P0 153 aa32.15■■■□□ 2.74
CXCL3-202ENST00000502974 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
CXCL3-202ENST00000502974 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
CXCL3-202ENST00000502974 C21orf2O43822 256 aa32.14■■■□□ 2.74
CXCL3-202ENST00000502974 TCIRG1Q13488 830 aa32.13■■■□□ 2.73
CXCL3-202ENST00000502974 NTSR2O95665 410 aa32.12■■■□□ 2.73
CXCL3-202ENST00000502974 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
CXCL3-202ENST00000502974 RIC1Q4ADV7 1423 aa32.1■■■□□ 2.73
CXCL3-202ENST00000502974 RIC3Q7Z5B4 369 aa32.1■■■□□ 2.73
CXCL3-202ENST00000502974 VAMP4O75379 141 aa32.09■■■□□ 2.73
CXCL3-202ENST00000502974 SOGA3Q5TF21 947 aa32.09■■■□□ 2.73
CXCL3-202ENST00000502974 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa32.08■■■□□ 2.73
CXCL3-202ENST00000502974 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa32.08■■■□□ 2.73
CXCL3-202ENST00000502974 NFKBIEO00221 500 aa32.08■■■□□ 2.73
CXCL3-202ENST00000502974 LMNB1P20700 586 aa32.08■■■□□ 2.73
CXCL3-202ENST00000502974 NLRP10Q86W26 655 aa32.08■■■□□ 2.73
CXCL3-202ENST00000502974 CRY2Q49AN0 593 aa32.07■■■□□ 2.72
CXCL3-202ENST00000502974 RNF123Q5XPI4 1314 aa32.06■■■□□ 2.72
CXCL3-202ENST00000502974 DDX58O95786 925 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
CXCL3-202ENST00000502974 SLC4A2P04920 1241 aa32.06■■■□□ 2.72
CXCL3-202ENST00000502974 ALDH1B1P30837 517 aa32.06■■■□□ 2.72
CXCL3-202ENST00000502974 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
CXCL3-202ENST00000502974 CACNA1FO60840 1977 aa32.05■■■□□ 2.72
CXCL3-202ENST00000502974 E9PSI1 815 aa32.05■■■□□ 2.72
CXCL3-202ENST00000502974 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa32.05■■■□□ 2.72
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF428Q96B54 188 aa32.05■■■□□ 2.72
CXCL3-202ENST00000502974 ISCA1Q9BUE6 129 aa32.04■■■□□ 2.72
CXCL3-202ENST00000502974 C1QTNF8P60827 252 aa32.03■■■□□ 2.72
CXCL3-202ENST00000502974 G2E3Q7L622 706 aa32.03■■■□□ 2.72
CXCL3-202ENST00000502974 TAOK3Q9H2K8 898 aa32.03■■■□□ 2.72
CXCL3-202ENST00000502974 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
CXCL3-202ENST00000502974 CCDC93Q567U6 631 aa32.02■■■□□ 2.72
CXCL3-202ENST00000502974 NLRP3Q96P20 1036 aa32.02■■■□□ 2.72
CXCL3-202ENST00000502974 MYD88Q99836 296 aa32.02■■■□□ 2.72
CXCL3-202ENST00000502974 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.72
CXCL3-202ENST00000502974 TIAM2Q8IVF5 1701 aa32.01■■■□□ 2.72
CXCL3-202ENST00000502974 SLFN5Q08AF3 891 aa32.01■■■□□ 2.71
CXCL3-202ENST00000502974 LTBP3Q9NS15 1303 aa32■■■□□ 2.71
CXCL3-202ENST00000502974 PRELPP51888 382 aa32■■■□□ 2.71
CXCL3-202ENST00000502974 SLC10A5Q5PT55 438 aa32■■■□□ 2.71
CXCL3-202ENST00000502974 C7orf43Q8WVR3 580 aa32■■■□□ 2.71
CXCL3-202ENST00000502974 CDCA7LQ96GN5 454 aa32■■■□□ 2.71
CXCL3-202ENST00000502974 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
CXCL3-202ENST00000502974 SH3TC1Q8TE82 1336 aa32■■■□□ 2.71
CXCL3-202ENST00000502974 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa31.99■■■□□ 2.71
CXCL3-202ENST00000502974 KDM2BQ8NHM5 1336 aa31.99■■■□□ 2.71
CXCL3-202ENST00000502974 PI4KAP2A4QPH2 592 aa31.98■■■□□ 2.71
CXCL3-202ENST00000502974 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
CXCL3-202ENST00000502974 FLIIQ13045 1269 aa31.98■■■□□ 2.71
CXCL3-202ENST00000502974 KSR2Q6VAB6 950 aa31.98■■■□□ 2.71
CXCL3-202ENST00000502974 SYNE4Q8N205 404 aa31.98■■■□□ 2.71
CXCL3-202ENST00000502974 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa31.98■■■□□ 2.71
CXCL3-202ENST00000502974 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
CXCL3-202ENST00000502974 C3orf67Q6ZVT6 689 aa31.97■■■□□ 2.71
CXCL3-202ENST00000502974 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
CXCL3-202ENST00000502974 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP31.96■■■□□ 2.71
CXCL3-202ENST00000502974 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
CXCL3-202ENST00000502974 LAMB2P55268 1798 aa31.96■■■□□ 2.71
CXCL3-202ENST00000502974 RTKN2Q8IZC4 609 aa31.95■■■□□ 2.71
CXCL3-202ENST00000502974 CRAMP1Q96RY5 1269 aa31.95■■■□□ 2.71
CXCL3-202ENST00000502974 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
CXCL3-202ENST00000502974 OLFM4Q6UX06 510 aa31.94■■■□□ 2.7
CXCL3-202ENST00000502974 FAM89AQ96GI7 184 aa31.94■■■□□ 2.7
CXCL3-202ENST00000502974 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
CXCL3-202ENST00000502974 KIF3CO14782 793 aa31.93■■■□□ 2.7
CXCL3-202ENST00000502974 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
CXCL3-202ENST00000502974 NMRK2Q9NPI5 230 aa31.93■■■□□ 2.7
CXCL3-202ENST00000502974 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP31.92■■■□□ 2.7
CXCL3-202ENST00000502974 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP31.91■■■□□ 2.7
CXCL3-202ENST00000502974 NEXNQ0ZGT2 675 aa31.91■■■□□ 2.7
CXCL3-202ENST00000502974 CCDC191Q8NCU4 936 aa31.91■■■□□ 2.7
CXCL3-202ENST00000502974 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP31.9■■■□□ 2.7
CXCL3-202ENST00000502974 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa31.9■■■□□ 2.7
CXCL3-202ENST00000502974 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
CXCL3-202ENST00000502974 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
CXCL3-202ENST00000502974 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP31.88■■■□□ 2.69
CXCL3-202ENST00000502974 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP31.88■■■□□ 2.69
CXCL3-202ENST00000502974 ABCC4O15439 1325 aa31.87■■■□□ 2.69
CXCL3-202ENST00000502974 GLTPD2A6NH11 291 aa31.87■■■□□ 2.69
CXCL3-202ENST00000502974 IGKV5-2P06315 115 aa31.87■■■□□ 2.69
CXCL3-202ENST00000502974 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
CXCL3-202ENST00000502974 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
CXCL3-202ENST00000502974 GRIPAP1Q4V328 841 aa31.86■■■□□ 2.69
CXCL3-202ENST00000502974 DPY19L2Q6NUT2 758 aa31.86■■■□□ 2.69
CXCL3-202ENST00000502974 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
CXCL3-202ENST00000502974 DNAAF4Q8WXU2 420 aa31.86■■■□□ 2.69
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
CXCL3-202ENST00000502974 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
CXCL3-202ENST00000502974 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
CXCL3-202ENST00000502974 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
CXCL3-202ENST00000502974 PSMD1Q99460 953 aa31.84■■■□□ 2.69
CXCL3-202ENST00000502974 RRAGCQ9HB90 399 aa31.84■■■□□ 2.69
CXCL3-202ENST00000502974 SNED1Q8TER0 1413 aa31.83■■■□□ 2.69
CXCL3-202ENST00000502974 NEURL1BA8MQ27 555 aa31.83■■■□□ 2.69
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