RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498448.1

C1orf109-212, Transcript of chromosome 1 open reading frame 109, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf109, Length 747 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109-212ENST00000498448 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.27■■□□□ 1.32
C1orf109-212ENST00000498448 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.26■■□□□ 1.31
C1orf109-212ENST00000498448 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
C1orf109-212ENST00000498448 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
C1orf109-212ENST00000498448 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
C1orf109-212ENST00000498448 SLC10A5Q5PT55 438 aa23.25■■□□□ 1.31
C1orf109-212ENST00000498448 STYK1Q6J9G0 422 aa23.25■■□□□ 1.31
C1orf109-212ENST00000498448 TTLL6Q8N841 843 aa23.25■■□□□ 1.31
C1orf109-212ENST00000498448 CCDC191Q8NCU4 936 aa23.25■■□□□ 1.31
C1orf109-212ENST00000498448 CNKSR1Q969H4 720 aa23.25■■□□□ 1.31
C1orf109-212ENST00000498448 MASTLQ96GX5 879 aa23.25■■□□□ 1.31
C1orf109-212ENST00000498448 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.25■■□□□ 1.31
C1orf109-212ENST00000498448 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.25■■□□□ 1.31
C1orf109-212ENST00000498448 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.25■■□□□ 1.31
C1orf109-212ENST00000498448 SRGNP10124 158 aa23.24■■□□□ 1.31
C1orf109-212ENST00000498448 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
C1orf109-212ENST00000498448 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.24■■□□□ 1.31
C1orf109-212ENST00000498448 NPR1P16066 1061 aa23.23■■□□□ 1.31
C1orf109-212ENST00000498448 NLRP3Q96P20 1036 aa23.23■■□□□ 1.31
C1orf109-212ENST00000498448 ADCY9O60503 1353 aa23.23■■□□□ 1.31
C1orf109-212ENST00000498448 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.22■■□□□ 1.31
C1orf109-212ENST00000498448 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.22■■□□□ 1.31
C1orf109-212ENST00000498448 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
C1orf109-212ENST00000498448 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
C1orf109-212ENST00000498448 ABCC12Q96J65 1359 aa23.21■■□□□ 1.31
C1orf109-212ENST00000498448 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
C1orf109-212ENST00000498448 ALDH1B1P30837 517 aa23.2■■□□□ 1.3
C1orf109-212ENST00000498448 CRY2Q49AN0 593 aa23.2■■□□□ 1.3
C1orf109-212ENST00000498448 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
C1orf109-212ENST00000498448 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.2■■□□□ 1.3
C1orf109-212ENST00000498448 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
C1orf109-212ENST00000498448 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa23.19■■□□□ 1.3
C1orf109-212ENST00000498448 PTPRCP08575 1304 aa23.18■■□□□ 1.3
C1orf109-212ENST00000498448 FAM89AQ96GI7 184 aa23.18■■□□□ 1.3
C1orf109-212ENST00000498448 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.18■■□□□ 1.3
C1orf109-212ENST00000498448 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.18■■□□□ 1.3
C1orf109-212ENST00000498448 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
C1orf109-212ENST00000498448 IGKV5-2P06315 115 aa23.17■■□□□ 1.3
C1orf109-212ENST00000498448 LINS1Q8NG48 757 aa23.17■■□□□ 1.3
C1orf109-212ENST00000498448 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
C1orf109-212ENST00000498448 CACNA1FO60840 1977 aa23.17■■□□□ 1.3
C1orf109-212ENST00000498448 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.17■■□□□ 1.3
C1orf109-212ENST00000498448 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.16■■□□□ 1.3
C1orf109-212ENST00000498448 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
C1orf109-212ENST00000498448 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
C1orf109-212ENST00000498448 SOGA3Q5TF21 947 aa23.16■■□□□ 1.3
C1orf109-212ENST00000498448 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23.16■■□□□ 1.3
C1orf109-212ENST00000498448 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
C1orf109-212ENST00000498448 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 SYNE4Q8N205 404 aa23.14■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 CRAMP1Q96RY5 1269 aa23.14■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.14■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 F6X3S4 739 aa23.13■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 CDHR2Q9BYE9 1310 aa23.12■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 DLEC1Q9Y238 1755 aa23.12■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 GCKRQ14397 625 aa23.12■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 BEND3Q5T5X7 828 aa23.12■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 C21orf2O43822 256 aa23.11■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.11■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.11■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.11■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 H7C1W4 665 aa23.1■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 PDE8AO60658 829 aa23.1■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 ALDH1L1O75891 902 aa23.1■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 YY1P25490 414 aa23.1■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 KIF16BQ96L93 1317 aa23.09■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.09■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 BBOX1O75936 387 aa23.08■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.08■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
C1orf109-212ENST00000498448 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
C1orf109-212ENST00000498448 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.07■■□□□ 1.28
C1orf109-212ENST00000498448 CCDC93Q567U6 631 aa23.07■■□□□ 1.28
C1orf109-212ENST00000498448 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.07■■□□□ 1.28
C1orf109-212ENST00000498448 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.07■■□□□ 1.28
C1orf109-212ENST00000498448 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
C1orf109-212ENST00000498448 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.07■■□□□ 1.28
C1orf109-212ENST00000498448 GRAPQ13588 217 aa23.06■■□□□ 1.28
C1orf109-212ENST00000498448 TMC4Q7Z404 712 aa23.06■■□□□ 1.28
C1orf109-212ENST00000498448 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.06■■□□□ 1.28
C1orf109-212ENST00000498448 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
C1orf109-212ENST00000498448 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.06■■□□□ 1.28
C1orf109-212ENST00000498448 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
C1orf109-212ENST00000498448 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
C1orf109-212ENST00000498448 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
C1orf109-212ENST00000498448 ABCC4O15439 1325 aa23.05■■□□□ 1.28
C1orf109-212ENST00000498448 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.04■■□□□ 1.28
C1orf109-212ENST00000498448 GRM8O00222 908 aa23.03■■□□□ 1.28
C1orf109-212ENST00000498448 LTBP3Q9NS15 1303 aa23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms