RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498428.5

ROBO1-211, Transcript of roundabout guidance receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ROBO1, Length 3,566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO1-211ENST00000498428 MON2Q7Z3U7 1717 aa8.7□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 KDRP35968 1356 aa8.7□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa8.7□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 ERVV-2B6SEH9 535 aa8.7□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 SIK1P57059 783 aa8.7□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa8.7□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 POTEAQ6S8J7 498 aa8.69□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 PDCL2Q8N4E4 241 aa8.69□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.69□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 SIL1Q9H173 461 aa8.69□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 ATG3Q9NT62 314 aa8.69□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 DDX19BQ9UMR2 479 aa8.69□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 TIGD1Q96MW7 591 aa8.69□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.69□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 TULP2O00295 520 aa8.68□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 TTLL7Q6ZT98 887 aa8.68□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.68□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa8.68□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 NFAT5O94916 1531 aa8.68□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 AKAP12Q02952 1782 aa8.68□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 ZPR1O75312 459 aa8.68□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 DNAAF4Q8WXU2 420 aa8.68□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa8.68□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 SLFN14P0C7P3 912 aa8.68□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 TNNT1P13805 278 aa8.68□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 MCM5P33992 734 aa8.68□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 DDIT3P35638 169 aa8.68□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 SEMA3FQ13275 785 aa8.68□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 FAM196AQ6ZSG2 479 aa8.68□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 RBSNQ9H1K0 784 aa8.68□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 RAD21O60216 631 aa8.67□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 RFC4P35249 363 aa8.67□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 MVPQ14764 893 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.67□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa8.67□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 TRERF1Q96PN7 1200 aa8.67□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 MEIS3Q99687 375 aa8.67□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa8.67□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF853P0CG23 659 aa8.67□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 ANKRD45Q5TZF3 282 aa8.67□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 MSL1Q68DK7 614 aa8.67□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 PEAK1Q9H792 1746 aa8.67□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 HYPKQ9NX55 129 aa8.67□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 A0A087WZG4 1122 aa8.67□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 ALDH1L2Q3SY69 923 aa8.67□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 DEFB132Q7Z7B7 95 aa8.67□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 BANK1Q8NDB2 785 aa8.67□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 GBP4Q96PP9 640 aa8.67□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 KIF3AQ9Y496 699 aa8.67□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 PALLDQ8WX93 1383 aa8.66□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.66□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 LNPKQ9C0E8 428 aa8.66□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 CCDC66A2RUB6 948 aa8.66□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 CRKLP46109 303 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 BARGINQ6ZT62 677 aa8.66□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 PDE3AQ14432 1141 aa8.65□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
ROBO1-211ENST00000498428 GOLIM4O00461 696 aa8.65□□□□□ -1.03
ROBO1-211ENST00000498428 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
ROBO1-211ENST00000498428 KIAA2012Q0VF49 1180 aa8.65□□□□□ -1.03
ROBO1-211ENST00000498428 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
ROBO1-211ENST00000498428 YY1AP1Q9H869 796 aa8.65□□□□□ -1.03
ROBO1-211ENST00000498428 CCDC39Q9UFE4 941 aa8.65□□□□□ -1.03
ROBO1-211ENST00000498428 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa8.65□□□□□ -1.03
ROBO1-211ENST00000498428 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
ROBO1-211ENST00000498428 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa8.64□□□□□ -1.03
ROBO1-211ENST00000498428 SLIT3O75094 1523 aa8.64□□□□□ -1.03
ROBO1-211ENST00000498428 LRP6O75581 1613 aa8.64□□□□□ -1.03
ROBO1-211ENST00000498428 SRGAP3O43295 1099 aa8.64□□□□□ -1.03
ROBO1-211ENST00000498428 SURF6O75683 361 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ROBO1-211ENST00000498428 RAB3GAP1Q15042 981 aa8.64□□□□□ -1.03
ROBO1-211ENST00000498428 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ROBO1-211ENST00000498428 FAM89AQ96GI7 184 aa8.64□□□□□ -1.03
ROBO1-211ENST00000498428 CCDC87Q9NVE4 849 aa8.64□□□□□ -1.03
ROBO1-211ENST00000498428 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ROBO1-211ENST00000498428 IQSEC2Q5JU85 1478 aa8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81 ms