RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 ZAP70P43403 619 aa8.05□□□□□ -1.12
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PTPRK-215ENST00000498284 ARSDP51689 593 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-215ENST00000498284 ECM1Q16610 540 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-215ENST00000498284 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-215ENST00000498284 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-215ENST00000498284 LAMC2Q13753 1193 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-215ENST00000498284 ATCAYQ86WG3 371 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-215ENST00000498284 HCN2Q9UL51 889 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-215ENST00000498284 EPB42P16452 691 aa8.03□□□□□ -1.12
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PTPRK-215ENST00000498284 KCNQ4P56696 695 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-215ENST00000498284 AAMPQ13685 434 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-215ENST00000498284 GAS6Q14393 721 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-215ENST00000498284 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-215ENST00000498284 STRN4Q9NRL3 753 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-215ENST00000498284 FAM13BQ9NYF5 915 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-215ENST00000498284 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-215ENST00000498284 KCNH4Q9UQ05 1017 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-215ENST00000498284 CD33P20138 364 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRK-215ENST00000498284 GMPRP36959 345 aa8.02□□□□□ -1.13
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PTPRK-215ENST00000498284 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
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PTPRK-215ENST00000498284 GPR152Q8TDT2 470 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRK-215ENST00000498284 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRK-215ENST00000498284 MARK1Q9P0L2 795 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRK-215ENST00000498284 USP20Q9Y2K6 914 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRK-215ENST00000498284 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRK-215ENST00000498284 CTBSQ01459 385 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRK-215ENST00000498284 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP8.01□□□□□ -1.13
PTPRK-215ENST00000498284 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRK-215ENST00000498284 FZD6O60353 706 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-215ENST00000498284 MX2P20592 715 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-215ENST00000498284 GRNP28799 593 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRK-215ENST00000498284 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRK-215ENST00000498284 GRIN2CQ14957 1233 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-215ENST00000498284 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-215ENST00000498284 FAM182BQ5T319 152 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-215ENST00000498284 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
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PTPRK-215ENST00000498284 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-215ENST00000498284 CCDC87Q9NVE4 849 aa7.99□□□□□ -1.13
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PTPRK-215ENST00000498284 C11orf16Q9NQ32 467 aa7.98□□□□□ -1.13
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PTPRK-215ENST00000498284 CCINQ13939 588 aa7.96□□□□□ -1.14
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PTPRK-215ENST00000498284 PRR12Q9ULL5 1215 aa7.96□□□□□ -1.14
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PTPRK-215ENST00000498284 SASH3O75995 380 aa7.94□□□□□ -1.14
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PTPRK-215ENST00000498284 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
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PTPRK-215ENST00000498284 BHMTQ93088 406 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRK-215ENST00000498284 PNMA5Q96PV4 448 aa7.94□□□□□ -1.14
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PTPRK-215ENST00000498284 GJD3Q8N144 294 aa7.93□□□□□ -1.14
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PTPRK-215ENST00000498284 A6NHS1 94 aa7.92□□□□□ -1.14
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PTPRK-215ENST00000498284 NFKB1P19838 968 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRK-215ENST00000498284 TARSP26639 723 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRK-215ENST00000498284 SYT9Q86SS6 491 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRK-215ENST00000498284 NLRP13Q86W25 1043 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRK-215ENST00000498284 RBCK1Q9BYM8 510 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRK-215ENST00000498284 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
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