RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496101.5

GCOM1-211, Transcript of GRINL1A complex locus 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GCOM1, Length 2,032 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCOM1-211ENST00000496101 RRP9O43818 475 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
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GCOM1-211ENST00000496101 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
GCOM1-211ENST00000496101 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
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GCOM1-211ENST00000496101 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.8■■□□□ 1.08
GCOM1-211ENST00000496101 RNF214Q8ND24 703 aa21.8■■□□□ 1.08
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GCOM1-211ENST00000496101 COL15A1P39059 1388 aa21.8■■□□□ 1.08
GCOM1-211ENST00000496101 MED23Q9ULK4 1368 aa21.8■■□□□ 1.08
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GCOM1-211ENST00000496101 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
GCOM1-211ENST00000496101 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
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GCOM1-211ENST00000496101 RNF20Q5VTR2 975 aa21.78■■□□□ 1.08
GCOM1-211ENST00000496101 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.78■■□□□ 1.08
GCOM1-211ENST00000496101 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.78■■□□□ 1.08
GCOM1-211ENST00000496101 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.78■■□□□ 1.08
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GCOM1-211ENST00000496101 ST3GAL1Q11201 340 aa21.77■■□□□ 1.08
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GCOM1-211ENST00000496101 SLC27A2O14975 620 aa21.77■■□□□ 1.07
GCOM1-211ENST00000496101 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
GCOM1-211ENST00000496101 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.77■■□□□ 1.07
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GCOM1-211ENST00000496101 ME3Q16798 604 aa21.76■■□□□ 1.07
GCOM1-211ENST00000496101 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.76■■□□□ 1.07
GCOM1-211ENST00000496101 FAM227BQ96M60 508 aa21.76■■□□□ 1.07
GCOM1-211ENST00000496101 COL18A1P39060 1754 aa21.76■■□□□ 1.07
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GCOM1-211ENST00000496101 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.75■■□□□ 1.07
GCOM1-211ENST00000496101 KCNJ4P48050 445 aa21.75■■□□□ 1.07
GCOM1-211ENST00000496101 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
GCOM1-211ENST00000496101 FSD1Q9BTV5 496 aa21.75■■□□□ 1.07
GCOM1-211ENST00000496101 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
GCOM1-211ENST00000496101 COPRSQ9NQ92 184 aa21.75■■□□□ 1.07
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GCOM1-211ENST00000496101 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
GCOM1-211ENST00000496101 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.74■■□□□ 1.07
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GCOM1-211ENST00000496101 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.73■■□□□ 1.07
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GCOM1-211ENST00000496101 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.73■■□□□ 1.07
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GCOM1-211ENST00000496101 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.72■■□□□ 1.07
GCOM1-211ENST00000496101 ELP1O95163 1332 aa21.72■■□□□ 1.07
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GCOM1-211ENST00000496101 ATP5JP18859 108 aa21.72■■□□□ 1.07
GCOM1-211ENST00000496101 RPS6KB1P23443 525 aa21.72■■□□□ 1.07
GCOM1-211ENST00000496101 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
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GCOM1-211ENST00000496101 BOLA2Q9H3K6 86 aa21.71■■□□□ 1.07
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GCOM1-211ENST00000496101 MYD88Q99836 296 aa21.7■■□□□ 1.06
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GCOM1-211ENST00000496101 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.68■■□□□ 1.06
GCOM1-211ENST00000496101 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
GCOM1-211ENST00000496101 TAF5LO75529 589 aa21.68■■□□□ 1.06
GCOM1-211ENST00000496101 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
GCOM1-211ENST00000496101 NECAB1Q8N987 351 aa21.68■■□□□ 1.06
GCOM1-211ENST00000496101 MYL6BP14649 208 aa21.67■■□□□ 1.06
GCOM1-211ENST00000496101 TNNI3KQ59H18 835 aa21.67■■□□□ 1.06
GCOM1-211ENST00000496101 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
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