RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495588.2

GAPVD1-218, Transcript of GTPase activating protein and VPS9 domains 1, humanhuman

TSL 5

Gene GAPVD1, Length 274 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1-218ENST00000495588 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.6□□□□□ -1.03
GAPVD1-218ENST00000495588 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa8.6□□□□□ -1.03
GAPVD1-218ENST00000495588 FMN1Q68DA7 1419 aa8.6□□□□□ -1.03
GAPVD1-218ENST00000495588 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
GAPVD1-218ENST00000495588 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
GAPVD1-218ENST00000495588 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.59□□□□□ -1.03
GAPVD1-218ENST00000495588 ZIC5Q96T25 663 aa8.59□□□□□ -1.03
GAPVD1-218ENST00000495588 ARHGEF11O15085 1522 aa8.59□□□□□ -1.03
GAPVD1-218ENST00000495588 PTPRGP23470 1445 aa8.58□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 FAM229AH3BQW9 127 aa8.58□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 IRF5Q13568 498 aa8.58□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 BICDL1Q6ZP65 573 aa8.58□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 SYT9Q86SS6 491 aa8.58□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.58□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 PLB1Q6P1J6 1458 aa8.57□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.57□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 M0R082 166 aa8.57□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF417Q8TAU3 575 aa8.57□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 STRN4Q9NRL3 753 aa8.57□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa8.57□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa8.57□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa8.57□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa8.57□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 BTBD11A6QL63 1104 aa8.56□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 EFSO43281 561 aa8.56□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 WWC1Q8IX03 1113 aa8.56□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.56□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 PRDM6Q9NQX0 595 aa8.56□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 CABP1Q9NZU7 370 aa8.56□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa8.56□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 FYCO1Q9BQS8 1478 aa8.56□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 ABCA8O94911 1581 aa8.56□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 HECW1Q76N89 1606 aa8.55□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.55□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 CDK2AP1O14519 115 aa8.55□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 SIN3BO75182 1162 aa8.55□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 ABL2P42684 1182 aa8.55□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 LRP8Q14114 963 aa8.55□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 SERTAD1Q9UHV2 236 aa8.55□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.54□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 MDFIQ99750 246 aa8.54□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 A6NJY4 79 aa8.53□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.53□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 H2AFB2P0C5Z0 115 aa8.53□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 GRIK4Q16099 956 aa8.53□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 WASHC4Q2M389 1173 aa8.53□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 SERPINA10Q9UK55 444 aa8.53□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.53□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 UACAQ9BZF9 1416 aa8.53□□□□□ -1.04
GAPVD1-218ENST00000495588 C9orf172C9J069 976 aa8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 MTFR1Q15390 333 aa8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 MAP7D1Q3KQU3 841 aa8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 ABCC2Q92887 1545 aa8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 CFAP43Q8NDM7 1665 aa8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 TIAM1Q13009 1591 aa8.52□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 ADCY10Q96PN6 1610 aa8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 ALBP02768 609 aa8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 NEUROD1Q13562 356 aa8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 MICALL1Q8N3F8 863 aa8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 TNFRSF25Q93038 417 aa8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 CCDC18Q5T9S5 1454 aa8.51□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 POM121CA8CG34 1229 aa8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 NEUROD4Q9HD90 331 aa8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 STARD13Q9Y3M8 1113 aa8.5□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 MAP3K1Q13233 1512 aa8.49□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 TMEM229AB2RXF0 380 aa8.49□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 NID1P14543 1247 aa8.49□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa8.49□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.49□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 ARID3AQ99856 593 aa8.49□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 PARP3Q9Y6F1 533 aa8.49□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 USP3Q9Y6I4 520 aa8.49□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 ATP10BO94823 1461 aa8.49□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa8.49□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 TXLNAP40222 546 aa8.48□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 ADH7P40394 386 aa8.48□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 ADGRE1Q14246 886 aa8.48□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 TRAPPC3LQ5T215 181 aa8.48□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 CYB5RLQ6IPT4 315 aa8.48□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 PLPP7Q8NBV4 271 aa8.48□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 GLMNQ92990 594 aa8.48□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa8.47□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 MBTPS1Q14703 1052 aa8.47□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 TXNRD3Q86VQ6 643 aa8.47□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.47□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa8.47□□□□□ -1.05
GAPVD1-218ENST00000495588 KDM5BQ9UGL1 1544 aa8.47□□□□□ -1.05
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