RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494664.5

TIMMDC1-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMMDC1, Length 2,394 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-208ENST00000494664 TMEM57Q8N5G2 664 aa14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1-208ENST00000494664 UBN2Q6ZU65 1347 aa14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1-208ENST00000494664 KDM2BQ8NHM5 1336 aa14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1-208ENST00000494664 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1-208ENST00000494664 BEND3Q5T5X7 828 aa14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1-208ENST00000494664 TBC1D9BQ66K14 1250 aa14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1-208ENST00000494664 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1-208ENST00000494664 CASZ1Q86V15 1759 aa14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1-208ENST00000494664 PXDNLA1KZ92 1463 aa14.78□□□□□ -0.04
TIMMDC1-208ENST00000494664 MSL1Q68DK7 614 aa14.78□□□□□ -0.04
TIMMDC1-208ENST00000494664 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TIMMDC1-208ENST00000494664 FLAD1Q8NFF5 587 aa14.78□□□□□ -0.04
TIMMDC1-208ENST00000494664 ATP10DQ9P241 1426 aa14.78□□□□□ -0.04
TIMMDC1-208ENST00000494664 TCIRG1Q13488 830 aa14.78□□□□□ -0.04
TIMMDC1-208ENST00000494664 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.78□□□□□ -0.04
TIMMDC1-208ENST00000494664 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TIMMDC1-208ENST00000494664 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
TIMMDC1-208ENST00000494664 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.77□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF34Q8IZ26 560 aa14.77□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 ISCA1Q9BUE6 129 aa14.77□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 COG6Q9Y2V7 657 aa14.77□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 PDE3AQ14432 1141 aa14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 C8orf34Q49A92 452 aa14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 LINS1Q8NG48 757 aa14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 NFIXQ14938 502 aa14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 COL24A1Q17RW2 1714 aa14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 NEXNQ0ZGT2 675 aa14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 NLRP10Q86W26 655 aa14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 ITPRIPQ8IWB1 547 aa14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 FAM177BA6PVY3 158 aa14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZBTB7AO95365 584 aa14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 RGL2O15211 777 aa14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 DDR1Q08345 913 aa14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 SKAP1Q86WV1 359 aa14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 SYNE4Q8N205 404 aa14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 GCKRQ14397 625 aa14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 SUSD4Q5VX71 490 aa14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 TM4SF1P30408 202 aa14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 SETDB2Q96T68 719 aa14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 MEIS3Q99687 375 aa14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 USP44Q9H0E7 712 aa14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 MMP10P09238 476 aa14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCDC191Q8NCU4 936 aa14.72□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 ALDH1L1O75891 902 aa14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 NUTM1Q86Y26 1132 aa14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 NTSR2O95665 410 aa14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 FAM89AQ96GI7 184 aa14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 PKNOX2Q96KN3 472 aa14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1-208ENST00000494664 GRM8O00222 908 aa14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 SLC16A10Q8TF71 515 aa14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 ABCC12Q96J65 1359 aa14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 CASP7P55210 303 aa14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 BECN1Q14457 450 aa14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 PARP10Q53GL7 1025 aa14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 MTFR1LQ9H019 292 aa14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 H7C1W4 665 aa14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 SERPINB2P05120 415 aa14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 ERFEQ4G0M1 354 aa14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 DDX19BQ9UMR2 479 aa14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 NRXN2Q9P2S2 1712 aa14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 UTYO14607 1347 aa14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 KAZALD1Q96I82 304 aa14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.67□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa14.67□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 CNBD1Q8NA66 436 aa14.67□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 SUCLG2Q96I99 432 aa14.67□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.67□□□□□ -0.06
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms