RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	KCNH2	Q12809	1159 aa		7.79	□□□□□ -1.16
DCTN1-222	ENST00000492717	PTK7	Q13308	1070 aa		7.79	□□□□□ -1.16
DCTN1-222	ENST00000492717	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	7.79	□□□□□ -1.16
DCTN1-222	ENST00000492717	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		7.79	□□□□□ -1.16
DCTN1-222	ENST00000492717	THAP11	Q96EK4	314 aa		7.79	□□□□□ -1.16
DCTN1-222	ENST00000492717	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		7.79	□□□□□ -1.16
DCTN1-222	ENST00000492717	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	7.79	□□□□□ -1.16
DCTN1-222	ENST00000492717	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		7.79	□□□□□ -1.16
DCTN1-222	ENST00000492717	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	7.79	□□□□□ -1.16
DCTN1-222	ENST00000492717	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	7.79	□□□□□ -1.16
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A1W2PP64	1363 aa		7.79	□□□□□ -1.16
DCTN1-222	ENST00000492717	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	7.79	□□□□□ -1.16
DCTN1-222	ENST00000492717	PXDN	Q92626	1479 aa		7.79	□□□□□ -1.16
DCTN1-222	ENST00000492717	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		7.78	□□□□□ -1.16
DCTN1-222	ENST00000492717	MSS51	Q4VC12	460 aa		7.78	□□□□□ -1.16
DCTN1-222	ENST00000492717	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		7.78	□□□□□ -1.16
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	7.78	□□□□□ -1.16
DCTN1-222	ENST00000492717	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		7.78	□□□□□ -1.16
DCTN1-222	ENST00000492717	POTEA	Q6S8J7	498 aa		7.78	□□□□□ -1.16
DCTN1-222	ENST00000492717	ZBTB33	Q86T24	672 aa		7.78	□□□□□ -1.16
DCTN1-222	ENST00000492717	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		7.78	□□□□□ -1.16
DCTN1-222	ENST00000492717	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	7.78	□□□□□ -1.16
DCTN1-222	ENST00000492717	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		7.78	□□□□□ -1.16
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM205C	A6NFA0	338 aa		7.77	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	APLP1	P51693	650 aa		7.77	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		7.77	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	SPSB2	Q99619	263 aa		7.77	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	CDK19	Q9BWU1	502 aa		7.77	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		7.77	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	7.77	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	NOD1	Q9Y239	953 aa		7.77	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		7.77	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		7.77	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	NSD2	O96028	1365 aa		7.76	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	ABCA3	Q99758	1704 aa		7.76	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	FOXO3	O43524	673 aa		7.76	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	ATP2B4	P23634	1241 aa		7.76	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		7.76	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	OGFOD1	Q8N543	542 aa		7.76	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	POGK	Q9P215	609 aa		7.76	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		7.76	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	CCER2	I3L3R5	266 aa		7.75	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	PSME1	Q06323	249 aa		7.75	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		7.75	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	ADAM32	Q8TC27	787 aa		7.75	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	PANK3	Q9H999	370 aa		7.75	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		7.75	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	USP6	P35125	1406 aa		7.75	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		7.75	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	SBNO1	A3KN83	1393 aa		7.74	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	7.74	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	DPYD	Q12882	1025 aa		7.74	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	7.74	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		7.74	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		7.74	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		7.74	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		7.74	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	PEAK1	Q9H792	1746 aa		7.74	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	LTN1	O94822	1766 aa		7.74	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		7.73	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	ST18	O60284	1047 aa		7.73	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	BCAM	P50895	628 aa		7.73	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	MMP16	P51512	607 aa		7.73	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	RNF20	Q5VTR2	975 aa		7.73	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	WNT2B	Q93097	391 aa		7.73	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	MARVELD3	Q96A59	401 aa		7.73	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		7.73	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	AFF2	P51816	1311 aa		7.73	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	SLIT3	O75094	1523 aa		7.73	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	RXRB	P28702	533 aa		7.72	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	OTUD5	Q96G74	571 aa		7.72	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	NFAT5	O94916	1531 aa		7.72	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	INSR	P06213	1382 aa		7.71	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	USP31	Q70CQ4	1352 aa		7.71	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		7.71	□□□□□ -1.17
DCTN1-222	ENST00000492717	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		7.71	□□□□□ -1.18
DCTN1-222	ENST00000492717	HR	O43593	1189 aa		7.71	□□□□□ -1.18
DCTN1-222	ENST00000492717	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
DCTN1-222	ENST00000492717	RALBP1	Q15311	655 aa		7.71	□□□□□ -1.18
DCTN1-222	ENST00000492717	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		7.71	□□□□□ -1.18
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	7.71	□□□□□ -1.18
DCTN1-222	ENST00000492717	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		7.71	□□□□□ -1.18
DCTN1-222	ENST00000492717	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
DCTN1-222	ENST00000492717	CABP1	Q9NZU7	370 aa		7.71	□□□□□ -1.18
DCTN1-222	ENST00000492717	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
DCTN1-222	ENST00000492717	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18

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