RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489379.1

EHD1-211, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene EHD1, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-211ENST00000489379 SLX4Q8IY92 1834 aa31.34■■■□□ 2.61
EHD1-211ENST00000489379 DDX58O95786 925 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
EHD1-211ENST00000489379 ALDH1B1P30837 517 aa31.34■■■□□ 2.61
EHD1-211ENST00000489379 CRY2Q49AN0 593 aa31.34■■■□□ 2.61
EHD1-211ENST00000489379 ABCC12Q96J65 1359 aa31.33■■■□□ 2.61
EHD1-211ENST00000489379 SLC10A5Q5PT55 438 aa31.33■■■□□ 2.61
EHD1-211ENST00000489379 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
EHD1-211ENST00000489379 RIC3Q7Z5B4 369 aa31.32■■■□□ 2.6
EHD1-211ENST00000489379 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
EHD1-211ENST00000489379 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
EHD1-211ENST00000489379 ISCA1Q9BUE6 129 aa31.31■■■□□ 2.6
EHD1-211ENST00000489379 ZNF521Q96K83 1311 aa31.3■■■□□ 2.6
EHD1-211ENST00000489379 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa31.3■■■□□ 2.6
EHD1-211ENST00000489379 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
EHD1-211ENST00000489379 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
EHD1-211ENST00000489379 NLRP3Q96P20 1036 aa31.3■■■□□ 2.6
EHD1-211ENST00000489379 C21orf2O43822 256 aa31.29■■■□□ 2.6
EHD1-211ENST00000489379 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
EHD1-211ENST00000489379 SH3TC1Q8TE82 1336 aa31.28■■■□□ 2.6
EHD1-211ENST00000489379 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
EHD1-211ENST00000489379 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa31.28■■■□□ 2.6
EHD1-211ENST00000489379 C9orf131Q5VYM1 1079 aa31.28■■■□□ 2.6
EHD1-211ENST00000489379 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
EHD1-211ENST00000489379 VAMP4O75379 141 aa31.26■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 LMNB1P20700 586 aa31.26■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 LTBP3Q9NS15 1303 aa31.25■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 C7orf43Q8WVR3 580 aa31.25■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 RNF181Q9P0P0 153 aa31.25■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 SLC4A2P04920 1241 aa31.24■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 CRAMP1Q96RY5 1269 aa31.24■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 NFKBIEO00221 500 aa31.23■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 CCDC93Q567U6 631 aa31.23■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 KSR2Q6VAB6 950 aa31.23■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa31.22■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 RASSF7Q02833 373 aa31.22■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa31.21■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 CCDC191Q8NCU4 936 aa31.21■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 LAMB2P55268 1798 aa31.2■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 E9PSI1 815 aa31.2■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 GRIPAP1Q4V328 841 aa31.2■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 RTKN2Q8IZC4 609 aa31.2■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 TAOK3Q9H2K8 898 aa31.2■■■□□ 2.59
EHD1-211ENST00000489379 MYD88Q99836 296 aa31.19■■■□□ 2.58
EHD1-211ENST00000489379 PI4KAP2A4QPH2 592 aa31.18■■■□□ 2.58
EHD1-211ENST00000489379 NEXNQ0ZGT2 675 aa31.18■■■□□ 2.58
EHD1-211ENST00000489379 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa31.18■■■□□ 2.58
EHD1-211ENST00000489379 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa31.18■■■□□ 2.58
EHD1-211ENST00000489379 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
EHD1-211ENST00000489379 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
EHD1-211ENST00000489379 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
EHD1-211ENST00000489379 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
EHD1-211ENST00000489379 FLIIQ13045 1269 aa31.16■■■□□ 2.58
EHD1-211ENST00000489379 FAM89AQ96GI7 184 aa31.16■■■□□ 2.58
EHD1-211ENST00000489379 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
EHD1-211ENST00000489379 C3orf67Q6ZVT6 689 aa31.15■■■□□ 2.58
EHD1-211ENST00000489379 SYNE4Q8N205 404 aa31.15■■■□□ 2.58
EHD1-211ENST00000489379 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP31.14■■■□□ 2.58
EHD1-211ENST00000489379 G2E3Q7L622 706 aa31.14■■■□□ 2.58
EHD1-211ENST00000489379 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
EHD1-211ENST00000489379 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
EHD1-211ENST00000489379 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
EHD1-211ENST00000489379 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
EHD1-211ENST00000489379 MIER1Q8N108 512 aa31.13■■■□□ 2.57
EHD1-211ENST00000489379 KDM2BQ8NHM5 1336 aa31.13■■■□□ 2.57
EHD1-211ENST00000489379 BBOX1O75936 387 aa31.12■■■□□ 2.57
EHD1-211ENST00000489379 PRELPP51888 382 aa31.12■■■□□ 2.57
EHD1-211ENST00000489379 SLFN5Q08AF3 891 aa31.12■■■□□ 2.57
EHD1-211ENST00000489379 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
EHD1-211ENST00000489379 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
EHD1-211ENST00000489379 TIAM2Q8IVF5 1701 aa31.12■■■□□ 2.57
EHD1-211ENST00000489379 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
EHD1-211ENST00000489379 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
EHD1-211ENST00000489379 TMC4Q7Z404 712 aa31.1■■■□□ 2.57
EHD1-211ENST00000489379 PSMD1Q99460 953 aa31.1■■■□□ 2.57
EHD1-211ENST00000489379 ABCC4O15439 1325 aa31.09■■■□□ 2.57
EHD1-211ENST00000489379 ZNF428Q96B54 188 aa31.09■■■□□ 2.57
EHD1-211ENST00000489379 DNAAF4Q8WXU2 420 aa31.08■■■□□ 2.57
EHD1-211ENST00000489379 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa31.08■■■□□ 2.57
EHD1-211ENST00000489379 IGKV5-2P06315 115 aa31.07■■■□□ 2.56
EHD1-211ENST00000489379 GRAPQ13588 217 aa31.07■■■□□ 2.56
EHD1-211ENST00000489379 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
EHD1-211ENST00000489379 SNED1Q8TER0 1413 aa31.07■■■□□ 2.56
EHD1-211ENST00000489379 CDHR2Q9BYE9 1310 aa31.06■■■□□ 2.56
EHD1-211ENST00000489379 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
EHD1-211ENST00000489379 DPY19L2Q6NUT2 758 aa31.06■■■□□ 2.56
EHD1-211ENST00000489379 GLTPD2A6NH11 291 aa31.05■■■□□ 2.56
EHD1-211ENST00000489379 NEURL1BA8MQ27 555 aa31.05■■■□□ 2.56
EHD1-211ENST00000489379 PDE8AO60658 829 aa31.05■■■□□ 2.56
EHD1-211ENST00000489379 OLFM4Q6UX06 510 aa31.05■■■□□ 2.56
EHD1-211ENST00000489379 SP8Q8IXZ3 490 aa31.05■■■□□ 2.56
EHD1-211ENST00000489379 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms