RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487849.7

HOXB-AS3-212, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 428 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-212ENST00000487849 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ALDH1B1P30837 517 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C9orf131Q5VYM1 1079 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NLRP3Q96P20 1036 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RNF181Q9P0P0 153 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ADCY9O60503 1353 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RASSF7Q02833 373 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CRY2Q49AN0 593 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-212ENST00000487849 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LMNB1P20700 586 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SLC4A2P04920 1241 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CCDC93Q567U6 631 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF428Q96B54 188 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MYD88Q99836 296 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TAOK3Q9H2K8 898 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NFKBIEO00221 500 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-212ENST00000487849 VAMP4O75379 141 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF521Q96K83 1311 aa25.33■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KSR2Q6VAB6 950 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SLX4Q8IY92 1834 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PI4KAP2A4QPH2 592 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 E9PSI1 815 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FAM89AQ96GI7 184 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SYNE4Q8N205 404 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FLIIQ13045 1269 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CACNA1SQ13698 1873 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MIER1Q8N108 512 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 G2E3Q7L622 706 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GRIPAP1Q4V328 841 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OLFM4Q6UX06 510 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ABCC4O15439 1325 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BBOX1O75936 387 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PRELPP51888 382 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SBF1O95248 1867 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SLFN5Q08AF3 891 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GRAPQ13588 217 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DPY19L2Q6NUT2 758 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IGKV5-2P06315 115 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PSMD1Q99460 953 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C1QTNF8P60827 252 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TMC4Q7Z404 712 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GLTPD2A6NH11 291 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PDE8AO60658 829 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-212ENST00000487849 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NMRK2Q9NPI5 230 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CACNA1FO60840 1977 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms